Risques connus et contre-indications

Dans les situations suivantes, l'administration d'une greffe UltraBiome est interdite. Aucun bénéfice clinique ne l'emporte sur ces risques.

• Immunodéficience sévère. Les 100 premiers jours après un traitement par CAR-T ; les 100 premiers jours après une allogreffe de cellules souches hématopoïétiques (HSCT) ; numération absolue des neutrophiles (ANC) < 1.0 G/L ; déficit immunitaire primitif connu (par exemple CVID, SCID).
• Cancer évolutif sous chimiothérapie. Pendant un traitement cytotoxique, la barrière muqueuse est altérée et le risque de translocation et de bactériémie est critique.
• Affection abdominale aiguë sévère. Gastroparésie diabétique aiguë, iléus, mégacôlon toxique, suspicion de perforation ou tout abdomen chirurgical actif.
• Grossesse. Il n'existe aucune donnée de sécurité sur la fœtotoxicité ; à éviter activement. Un test de grossesse positif impose l'arrêt immédiat du programme UB.
• Poussée active d'IBD. Maladie de Crohn avec CDAI > 220 ; rectocolite hémorragique avec score de Mayo > 9. Une réévaluation est nécessaire en phase de rémission.
• Antécédent d'anaphylaxie à un composant quelconque de la greffe UB (enveloppe de la gélule, excipient, matrice issue du donneur).

Les situations suivantes n'excluent pas absolument l'usage d'UB, mais exigent un jugement clinique individuel et souvent une concertation pluridisciplinaire.

• Allaitement. Aucune donnée. Un transfert bactérien vertical par sous-incubation est théoriquement possible ; uniquement après avis médical.
• Population pédiatrique (< 18 ans). Le programme UB n'est pas validé chez l'enfant. Uniquement sur indication particulière (par exemple TSA sévère avec chevauchement microbiome-IBD) et uniquement sous supervision clinique dédiée.
• Défaillance d'organe sévère. Insuffisance cardiaque NYHA III–IV ; cirrhose hépatique Child-Pugh C ; fonction rénale avec DFGe < 30 mL/min/1.73 m².
• Trouble du comportement alimentaire actif. Anorexie mentale, boulimie, hyperphagie boulimique (BED) en phase aiguë – la prise en charge spécialisée passe en premier ; le programme UB ne s'y substitue pas.
• Épisode psychotique actif ou trouble de l'humeur majeur non contrôlé. À éviter jusqu'à stabilisation.
• Immunosuppression chronique et intensive. Dans les protocoles post-transplantation ou d'auto-immunité sévère, uniquement en coordination avec l'équipe de transplantation.

En juin 2019, au Massachusetts General Hospital, deux patients immunodéprimés ont développé une bactériémie à E. coli producteur de BLSE à partir d'une même greffe de donneur FMT ; l'un des patients est décédé [49]. La FDA a émis une alerte de sécurité immédiate qui a remodelé la norme mondiale de sélection des donneurs.

Conséquences cliniques, également intégrées au protocole UB :

• Dépistage obligatoire des bactéries multirésistantes (MDRO) chez chaque donneur de FMT : BLSE/CPE/ERV dans les selles, plus écouvillonnage rectal.
• Le protocole donneur de MicroBiome Bank applique un dépistage élargi des MDRO, des virus, des parasites et des paramètres métaboliques ; les détails figurent dans le chapitre sur la sélection des donneurs du Microbiota Guide.
• Responsabilité du clinicien traitant : toute fièvre, tout sepsis d'origine inconnue ou toute suspicion de bactériémie après une greffe UB → hémocultures immédiates + dépistage MDRO. La fenêtre temporelle est critique : la détection précoce détermine l'issue.

Un patient atteint de SMet prend en moyenne 4 à 7 médicaments. Le tableau ci-dessous résume les interactions les plus fréquentes et la conduite clinique correspondante.

• Grossesse. Aucune donnée de sécurité. À éviter activement. Si une conception est envisagée, le protocole UB doit être arrêté avant la conception.
• Allaitement. Aucune donnée. Jugement individuel après avis médical.
• Fertilité. Aucune donnée sur les effets sur la fertilité masculine ou féminine.
• Chez une femme en âge de procréer, une contraception efficace est recommandée pendant le programme UB.

Dans la population de moins de 18 ans, le programme UB n'est pas validé. Dans des situations particulières (par exemple spectre autistique avec symptômes digestifs sévères associés), les études FMT sous IND en cours aux États-Unis fournissent un cadre de référence, mais UB n'entre pas dans ce cadre. En raison de la phase de croissance, l'évaluation bénéfice-risque est plus stricte, et un tel cas ne peut être initié qu'après une consultation de gastro-entérologie pédiatrique et d'infectiologie pédiatrique.

La surveillance des premières semaines suivant une greffe UB est critique. Schéma de décision rapide pour le clinicien :

• Fièvre > 38 °C dans les 72 premières heures → hémocultures + dépistage MDRO + antibiothérapie empirique à large spectre, selon le protocole sepsis.
• Événement digestif sévère (vomissements > 3 épisodes, selles sanglantes, douleur abdominale intense, signes péritonéaux) → hospitalisation en urgence, avis chirurgical d'urgence.
• Suspicion d'anaphylaxie (urticaire + hypotension, dyspnée, œdème laryngé) → adrénaline intramusculaire, soins d'urgence.
• Troubles digestifs chroniques légers (ballonnements, flatulences, modifications du transit) : fréquents et attendus dans les 2 à 4 premières semaines ; à surveiller, mais cela ne justifie pas à soi seul l'arrêt du programme.

Ce chapitre est un aide-mémoire pour le clinicien. Le protocole complet de sélection des donneurs, la traçabilité des lots UB et les SOP sont disponibles dans la documentation professionnelle de MicroBiome Bank.