VII. 2. Irodalomjegyzék

A „MicroBiota Kézikönyv" teljes irodalomjegyzéke a fejezetekben szereplő hivatkozási számok által eredeti tudományos forrásokat tartalmazza.

Mi található meg az irodalomjegyzékben?

Ez a függelék a könyv teljes irodalomjegyzékét tartalmazza egy helyen: minden olyan tudományos hivatkozást, amely a kötet bármely fejezetében hivatkozásra került. A szövegtörzsben látható `[12]`, `[325]` és további sorszámok a lentebb listázott tételekre utalnak — a számozás a könyv egészén végigfut, így ugyanaz a `[N]` hivatkozási szám mindig ugyanarra a forrásra mutat. A felsorolt közlemények túlnyomó többsége peer-reviewed folyóiratban jelent meg, és indexelt adatbázisokban (PubMed/NCBI, Crossref) is megtalálható, neves szakmai kiadók gondozásában.

Miért van összefoglaló minden tétel alatt?

Minden hivatkozás alatt egy 5–6 mondatos kivonat olvasható. Ez nem a cikk hivatalos absztraktja, hanem egy rövid, közérthető összegzés, amely bemutatja a vizsgálat hátterét, a használt módszert, a fő eredményt és annak klinikai vagy gyakorlati jelentőségét. A célja, hogy az olvasó gyorsan eldönthesse: érdemes-e a teljes közleményt elolvasnia, illeszkedik-e a saját kérdéséhez vagy a beteg élethelyzetéhez. A kivonatok segítenek tájékozódni akkor is, ha nincs közvetlen hozzáférés a teljes szöveghez.

Hogyan használandó?

Minden tétel alatt megtalálod a „Hivatkozás előfordulásai" sort: az itt feltüntetett fejezetszámra kattintva vissza lehet térni a könyv azon részéhez, ahol a forrást idézzük. Az adott fejezetben a `[N]` jelölésre kattintva ide, az irodalomjegyzékhez jut el az olvasó — így mindkét irányban szabadon lehet mozogni. A „Link" által jelölt hivatkozásra kattintva a kiadó vagy az NCBI oldalán nyílik meg a közlemény, ahol — ha a cikk díjmentesen hozzáférhető (open access) — a teljes szöveget is el lehet olvasni.

Hivatkozások

[7] van Nood E, Vrieze A, Nieuwdorp M et al. Duodenal infusion of donor feces for recurrent Clostridium difficile. N Engl J Med. 2013. Link

Nyílt elrendezésű randomizált vizsgálat visszatérő C. difficile-fertőzésben, amely duodenális donor-széklet infúziót (rövid vankomicin + bélmosás után) hasonlított össze 14 napos standard vankomicinnel, bélmosással vagy anélkül. Az elsődleges végpont a 10. hétre elért hasmenés-megszűnés volt visszaesés nélkül. A vizsgálatot köztes elemzésnél leállították: az FMT-karon 16 betegből 13 (81\%) érte el a megoldást egyetlen infúzió után, lényegesen meghaladva mindkét vankomicin-kart. A vizsgálat megalapozza az FMT antibiotikum-monoterápiával szembeni fölényét visszatérő CDI-ben, és mérföldkő-bizonyítékot szolgáltat a klinikai bevezetéshez.

[16] Sinha R, Abu-Ali G, Vogtmann E et al. Assessment of Variation in Microbial Community Amplicon Sequencing by the Microbiome Quality Control (MBQC) Project Consortium. Nature Biotechnology. 2017. Link

A Microbiome Quality Control (MBQC) baseline tanulmány 15 laboratórium és 9 bioinformatikai protokoll taxonómiai profilozási variabilitását mérte fel vakos székletmintákon, kemosztát- és mesterséges közösségi mintákon. A variabilitás leginkább a bioanyagminta típusától és eredetétől függött, ezt követte a DNS-kivonás, a mintakezelési környezet és a bioinformatikai csővezeték. A mesterséges közösségek elemzése kvantitatív különbségeket mutatott a kivonási hatékonyságban és a bioinformatikai osztályozásban. Az eredmények kiemelik a standardizáció szükségességét a populációszintű mikrobiomvizsgálatok meta-analíziséhez.

[18] Gloor GB, Macklaim JM, Pawlowsky-Glahn V, Egozcue JJ. Microbiome datasets are compositional: and this is not optional. Front Microbiol. 2017. Link

A 16S rRNS-amplikonok, metagenomok vagy metatranszkriptomok nagy áteresztőképességű szekvenálásával előállított mikrobiom-adatkészletek inherensen kompozícionálisak, mert a műszer önkényes összegzést kényszerít rá. A review bemutatja azokat a torzulásokat, amelyek a kompozíciós adatok nem kompozíciós módszerekkel való elemzéséből erednek, és iránymutatást ad a kompozíciós adatelemzés alkalmazására a mikrobiom-vizsgálatok teljes munkafolyamatában. A kompozíciós keret nem opcionális, hanem alapvető a valid következtetésekhez.

[19] Costea PI, Zeller G, Sunagawa S et al. Towards Standards for Human Fecal Sample Processing in Metagenomic Studies. Nature Biotechnology. 2017. Link

21 reprezentatív DNS-kivonási protokollt teszteltek azonos székletmintákon, és összevetették a könyvtárkészítés és tárolás hatásaival a biológiai egyénen belüli variációval. A DNS-kivonás bizonyult a legnagyobb technikai hatású tényezőnek a metagenomikai eredményekben. A protokollokat DNS-mennyiség, -minőség, közösségi diverzitás-torzítások és Gram-pozitív/Gram-negatív arány alapján rangsorolták. A szerzők egy standardizált, laboratóriumok közötti átvihetőséggel validált DNS-kivonási módszert javasolnak, amelyet ismert összetételű mock-közösséggel ellenőriztek emberi széklet-metagenomikához.

[21] McLaren MR, Willis AD, Callahan BJ. Consistent and Correctable Bias in Metagenomic Sequencing Experiments. eLife. 2019. Link

A marker-gén és metagenomikai szekvenálási mérések szisztematikusan torzítanak bizonyos taxonok detektálása felé, ami a különböző protokollokkal mért taxon-abundanciákat mennyiségileg összehasonlíthatatlanná és hibás biológiai következtetésekre hajlamossá teszi. A szerzők egy valós kísérleti tulajdonságokon alapuló matematikai modellt javasolnak a torzítás leírására, és definiált baktériumközösségekből származó 16S rRNS- és shotgun-metagenomikai adatokkal validálják. A modell jobban illeszkedik a kísérleti adatokra, mint a korábbi, bonyolultabb keretrendszerek, és utat kínál a torzítás korrekciójára.

[22] Sczyrba A, Hofmann P, Belmann P et al. Critical Assessment of Metagenome Interpretation -- A Benchmark of Metagenomics Software. Nature Methods. 2017. Link

A Critical Assessment of Metagenome Interpretation (CAMI) kihívás metagenomikai szoftvereket hasonlított össze ~700 újonnan szekvenált mikroorganizmusból és ~600 új vírusból és plazmidból álló, rendkívül komplex realisztikus adatkészleteken. Az assembly és binning jól teljesített egyedi genomokkal reprezentált fajoknál, de jelentősen romlott közelrokon törzsek jelenlétében. A taxonómiai profilozás és binning magas taxonómiai szinteken volt megbízható, családi szint alatt markáns teljesítményesés volt. A paraméterbeállítások erősen befolyásolták a teljesítményt, kiemelve a reprodukálhatóság jelentőségét. A CAMI útmutatást ad a szoftverválasztáshoz.

[28] Vétizou M, Pitt JM, Daillère R et al. Anticancer immunotherapy by CTLA-4 blockade relies on the gut microbiota. Science. 2015. Link

A CTLA-4 gátlás daganatellenes hatása specifikus Bacteroides fajoktól függ. Egerekben és betegekben a B. thetaiotaomicron vagy B. fragilis elleni T-sejt válaszok korreláltak a kezelés hatékonyságával. Antibiotikummal kezelt vagy csíramentes egerek nem reagáltak anti-CTLA-4-re, és a hiány B. fragilis gavázzsal, poliszacharid immunizálással vagy B. fragilis-specifikus T-sejtek transzferével pótolható volt. Emberről egérre végzett fekális mikrobiota-transzplantáció megerősítette, hogy a CTLA-4 kezelés melanómás betegekben a daganatellenes B. fragilis kinövését favorizálja.

[36] Cammarota G, Ianiro G, Tilg H et al. European consensus conference on faecal microbiota transplantation in clinical practice. Gut. 2017. Link

Európai konszenzus-konferencia, amely bizonyítékalapú ajánlásokat dolgozott ki az FMT klinikai alkalmazására, 10 ország 28 szakértőjének közreműködésével, munkacsoportokban. Az állításokat bizonyítékalapú áttekintéssel készítették, elektronikus Delphi-folyamatban értékelték, és plenáris konszenzus-ülésen véglegesítették. Az ajánlások lefedik az FMT-indikációkat, a donor-szelekciót, a székletanyag előkészítését, a klinikai kezelést, a széklet-bejuttatást és az FMT-központ alapításának minimális követelményeit. A dokumentum európai standardizációs keretet ad a biztonságos és szabályozott FMT-bejuttatáshoz.

[59] Thaiss CA, Zeevi D, Levy M et al. Transkingdom control of microbiota diurnal oscillations promotes metabolic homeostasis. Cell. 2014. Link

Egéren és emberen végzett mechanisztikus vizsgálat, amely kimutatja, hogy a bélmikrobiota diurnális ingadozást mutat, amelyet az étkezési ritmus hajt, és időspecifikus összetételi és funkcionális profilokat termel. A gazdaszervezet molekuláris óra-komponenseinek károsítása vagy jet-lag rendellenes mikrobiota-ingadozást és dysbiosist okozott a sérült étkezési ritmuson keresztül. A jet-lag által indukált dysbiosis mindkét fajban glükóz-intoleranciát és elhízást váltott ki, amely FMT-vel átvihető volt csíramentes recipiensekbe. A mikrobiota–gazda cirkadián kereszt-szabályozást metabolikus betegség-mechanizmusként azonosítja.

[60] Benedict C, Vogel H, Jonas W et al. Gut microbiota and glucometabolic alterations in response to recurrent partial sleep deprivation in normal-weight young individuals. Mol Metab. 2016. Link

Randomizált, alanyon belüli keresztezett vizsgálat 9 normál testsúlyú férfinél, amely két éjszakai részleges alvásdeprivációt (PSD; 02:45–07:00) hasonlított össze két éjszakai normál alvással (22:30–07:00) standardizált laboratóriumi étkezés és testmozgás mellett. Székletmintákat gyűjtöttek, és orális glükóz-toleranciatesztet végeztek. A vizsgálat azt értékelte, hogy a rövid távú alvásmegvonás megváltoztatja-e a bélmikrobiota összetételét és metabolikus működését, korai humán bizonyítékot adva az alváskorlátozás és az akut mikrobiota-változások és inzulinrezisztencia kapcsolatára.

[62] Clarke SF, Murphy EF, O'Sullivan O et al. Exercise and associated dietary extremes impact on gut microbial diversity. Gut. 2014. Link

Keresztmetszeti 16S rRNS-amplikon vizsgálat, amely professzionális rögbisek és testméretben, életkorban és nemben illesztett kontrollcsoportok bélmikrobiotáját hasonlította össze. A sportolóknál nagyobb mikrobiális diverzitás és eltérő közösségi szerkezet jelentkezett, mind a szélsőséges testmozgással, mind a kísérő étrendi eltérésekkel összefüggésben. A vizsgálat korai bizonyítékot ad arra, hogy az elit-szintű testmozgás és étrend együttesen formálják a bélmikrobiotát, megalapozva a testmozgás–étrend–mikrobiom triász metabolikus és immun-egészséggel kapcsolatos vizsgálatát.

[93] Goldenberg JZ, Yap C, Lytvyn L et al. Probiotics for the prevention of Clostridium difficile-associated diarrhea in adults and children. Cochrane Database Syst Rev. 2017. Link

Szisztematikus áttekintés az antibiotikumot kapó felnőtteknél a Clostridium difficile-asszociált hasmenés elsődleges megelőzésére alkalmazott probiotikumokról. Az áttekintés értékeli a hatékonyságot és biztonságosságot azzal a háttérrel, hogy az irányelvek a magas színvonalú probiotikus bizonyítékok ellenére nem javasolják a probiotikus profilaxist. A szintézis támogatja a probiotikus profilaxist mint hatékony és biztonságos beavatkozást megfelelően kiválasztott, antibiotikumon lévő, kórházi felnőtteknél.

[106] Wastyk HC, Fragiadakis GK, Perelman D et al. Gut-microbiota-targeted diets modulate human immune status. Cell. 2021. Link

17 hetes randomizált prospektív vizsgálat (n=18/kar) egészséges felnőtteknél, amely magas rost- és magas erjesztett-élelmiszer étrendet hasonlított össze multi-omikai mikrobiom- és gazda-immunprofilozással. A magas rosttartalmú étrend növelte a mikrobiom-kódolt glikán-bontó CAZymeket, miközben a diverzitás stabil maradt. A magas erjesztett-élelmiszeres étrend növelte a mikrobiom-diverzitást, és csökkentette több gyulladásos marker szintjét. Az eredmények étrend-specifikus mikrobiom–immun hatásokat mutatnak ki, és az erjesztett élelmiszereket a bél–immun tengely erős, diverzitást fokozó modulátoraként támogatják.

[122] Costantini L, Molinari R, Farinon B, Merendino N. Impact of Omega-3 Fatty Acids on the Gut Microbiota. Int J Mol Sci. 2017. Link

A hosszú távú táplálkozási szokások gazdaspecifikus bélmikrobiotát alakítanak ki, de az étkezési zsírok hatása kevésbé jellemzett, mint a szénhidrátoké. A néhány felnőtt humán omega-3 PUFA-szupplementációs vizsgálat konzisztens változásokat mutat: csökkent Faecalibacterium, megnövekedett Bacteroidetes és butirátot termelő Lachnospiraceae. Mivel ezeknek a taxonoknak a diszbiózisa megfigyelhető gyulladásos bélbetegségben, az omega-3 PUFA-k kedvező hatásukat a mikrobiom-összetétel helyreállításával és a gyulladáscsökkentő rövidláncú zsírsavak termelésének fokozásával fejthetik ki.

[141] David LA, Maurice CF, Carmody RN et al. Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome. Nature. 2014. Link

Tisztán állati vagy növényi termékekből álló étrend rövid távú fogyasztása drámai, reprodukálható eltolódásokat váltott ki az emberi bélmikrobiális közösség szerkezetében, amelyek elnyomták az egyének közti különbségeket. Az állati étrend növelte az epesav-toleráns mikrobákat (Alistipes, Bilophila, Bacteroides) és csökkentette a növényi poliszacharidokat fermentáló Firmicutes-eket (Roseburia, E. rectale, R. bromii), tükrözve a növényevő-húsevő mintázatokat. A Bilophila wadsworthia kivirágzott az állati étrenden, mechanisztikusan összekapcsolva az étkezési zsírt, az epesavakat és a gyulladásos bélbetegséget kiváltani képes mikrobák kinövését.

[154] Suez J, Korem T, Zeevi D et al. Artificial sweeteners induce glucose intolerance by altering the gut microbiota. Nature. 2014. Link

A kalóriamentes mesterséges édesítőszerek (NAS) glükózintoleranciát indukáltak egerekben és emberekben a bélmikrobiota összetételi és funkcionális megváltoztatása révén. Antibiotikum-kezelés eltüntette a káros metabolikus hatásokat, és csíramentes egerek, amelyek NAS-fogyasztó egerek székletét (vagy NAS-szal inkubált mikrobiotát) kaptak transzplantátumként, glükózintoleranciát alakítottak ki. A NAS-módosított mikrobiális metabolikus útvonalak metabolikus betegségfogékonysággal álltak kapcsolatban, és hasonló diszbiózis és glükózintolerancia jelent meg egészséges humán résztvevőkben is. Az eredmények a tömeges NAS-használat újraértékelésére szólítanak fel.

[159] Chassaing B, Koren O, Goodrich JK et al. Dietary emulsifiers impact the mouse gut microbiota promoting colitis and metabolic syndrome. Nature. 2015. Link

Vad típusú egerekben két, mindenütt jelen lévő emulgeálószer — a karboximetil-cellulóz (CMC) és a poliszorbát-80 (P80) — viszonylag alacsony koncentrációja alacsony fokú gyulladást és elhízás/metabolikus szindrómát indukált, és kifejezett colitist váltott ki arra hajlamosított egerekben. A mucus-védőgát és a mikrobiota-összetétel megsérült. Az eredmények arra utalnak, hogy a feldolgozott élelmiszerek ubikvitárius emulgeálószerei összefügghetnek a 20. század közepe óta tapasztalt gyulladásos bélbetegség- és metabolikus zavar-növekedéssel.

[161] Desai MS, Seekatz AM, Koropatkin NM et al. A dietary fiber-deprived gut microbiota degrades the colonic mucus barrier and enhances pathogen susceptibility. Cell. 2016. Link

Gnobiotikus, szintetikus emberi bélmikrobiotával kolonizált egerekben krónikus vagy intermittáló étrendi rostmegvonás arra késztette a mikrobiotát, hogy a gazda által szekretált mucus-glikoproteineket használja tápanyagforrásként, erodálva a vastagbél nyálkahártya-gátját. A rostmegvonás és a nyálkahártya-eroziós mikrobiota együttesen nagyobb epitéliumhoz való hozzáférést és letális colitist tett lehetővé a Citrobacter rodentium nyálkahártya-patogén által. Az eredmények összekapcsolják a táplálkozást, mikrobiomot és a bélnyálkahártya-gát diszfunkcióját, és kiemelik az étkezési rostot mint kulcsfontosságú, terápiásan kihasználható gát-védő tényezőt.

[162] Suez J, Cohen Y, Valdés-Mas R et al. Personalized microbiome-driven effects of non-nutritive sweeteners on human glucose tolerance. Cell. 2022. Link

Randomizált kontrollált vizsgálat 120 egészséges felnőttön, akik szacharint, szukralózt, aszpartámot vagy steviát kaptak (az elfogadható napi bevitel alatti dózisban) vs. glükóz-vivőanyag vagy szupplementáció nélküli kontroll 2 héten át. Mind a négy nem-tápláló édesítőszer eltérően módosította a széklet- és szájmikrobiomot, valamint a plazma metabolomot; a szacharin és a szukralóz szignifikánsan rontotta a glikémiás választ. A humán top- és bottom-válaszadók mikrobiomjával kolonizált gnobiotikus egerek donor-specifikus glikémiás válaszokat reprodukáltak, kimutatva, hogy a nem-tápláló édesítőszerek személyre szabott, mikrobiom-függő glikémiás változásokat indukálhatnak.

[172] Halmos EP, Power VA, Shepherd SJ, Gibson PR, Muir JG. A diet low in FODMAPs reduces symptoms of irritable bowel syndrome. Gastroenterology. 2014. Link

Randomizált, egyszeresen vak, keresztezett vizsgálat 30 IBS-betegen és 8 kontrollon összehasonlított egy alacsony FODMAP-tartalmú étrendet (<0,5 g/étkezés) egy tipikus ausztrál étrenddel 21-21 napon át (>=21 napos kimosási idővel). Csaknem minden ételt biztosítottak. Az alacsony FODMAP-os kar szignifikánsan nagyobb IBS-tünetcsökkenést eredményezett 0-100 mm-es vizuális analóg skálán mérve, alátámasztva az alacsony FODMAP étrendet mint a tünetkontroll hatékony beavatkozását IBS-ben a standard nyugati étrendhez képest.

[204] Allen JM, Mailing LJ, Niemiro GM et al. Exercise alters gut microbiota composition and function in lean and obese humans. Med Sci Sports Exerc. 2018. Link

A 6 hetes állóképességi tréning vizsgálatban 32 addig ülő életmódú sovány (n=18) és elhízott (n=14) felnőtt vett részt; az edzés a maximális pulzustartalék 60-75%-án, heti 3 alkalommal, 30-ról 60 percre emelkedve zajlott, majd 6 hetes washout követte. A béta-diverzitás elemzés szerint a mozgás indukálta mikrobiom-változások az elhízottsági státusztól függtek. Az állóképességi edzés a gazdaszervezet fenotípusától függő módon alakítja át a bélmikrobiótát, és a hatások részben visszafordulnak az inaktivitás visszatértével.

[213] Cryan JF, Dinan TG. Mind-altering microorganisms: the impact of the gut microbiota on brain and behaviour. Nat Rev Neurosci. 2012. Link

A közlemény áttekinti a bélmikrobióta agyműködésre és viselkedésre gyakorolt hatását neurális, endokrin és immun-útvonalakon keresztül. Germ-free állatok, kórokozó-fertőzés, probiotikus és antibiotikus modellek igazolják a bélbaktériumok szerepét a szorongás, hangulat, kognitív funkciók és fájdalom szabályozásában. A mikrobióta-bél-agy tengely új gyógyszercélpont komplex központi idegrendszeri kórképekben. A szerzők transzlációs, humán okozati vizsgálatokat sürgetnek.

[218] Dethlefsen L, Relman DA. Incomplete recovery and individualized responses of the human distal gut microbiota to repeated antibiotic perturbation. Proc Natl Acad Sci USA. 2011. Link

A longitudinális vizsgálat három egyén distalis bélmikrobiótáját követte 10 hónapig két ciprofloxacin-kúrát átfogva, 1,7 millió 16S rRNS-szekvenciát elemezve 52-56 mintából személyenként. Az egyének közötti variabilitás dominált; az alap-mikrobiom-közösségek hónapokon át stabilak voltak. A ciprofloxacin a kúra megkezdésétől számított 3-4 napon belül drámaian csökkentette a diverzitást és átalakította az összetételt; a regeneráció hiányos és egyénfüggő volt. Az eredmények a bélmikrobióta rezilienciáját és az ismételt fluorokinolon expozíció tartós zavaró hatását jellemzik.

[222] Forslund K, Hildebrand F, Nielsen T et al. Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota. Nature. 2015. Link

A vizsgálat 784 humán bélmetagenom alapján különítette el a 2-es típusú diabéteszes (T2D) mikrobiom-jelet az antidiabetikus szerek hatásától, és kimutatta, hogy az antidiabetikus gyógyszerelés — különösen a metformin — összemossa a korábbi T2D-diszbiózis adatokat. A szerzők bizonyítékot adnak arra, hogy a mikrobiota rövid szénláncú zsírsav-termelésen keresztül közvetíti a metformin terápiás hatásait, és hogy az ismert tápcsatornai mellékhatások mögött Escherichia-fajok relatív gyarapodása áll. A vizsgálat rámutat: a gyógyszereléses státuszt kontrollálni kell a betegségasszociált mikrobiom-leírásokban.

[229] Maier L, Pruteanu M, Kuhn M et al. Extensive impact of non-antibiotic drugs on human gut bacteria. Nature. 2018. Link

A vizsgálat több mint 1000 forgalmazott gyógyszert tesztelt in vitro 40 reprezentatív bélbaktérium-törzs ellen, és kimutatta, hogy a humán célpontú gyógyszerek 24%-a — minden terápiás osztály képviseltetésével — legalább egy törzs növekedését gátolta. Az antipszichotikumok felülreprezentáltak voltak. A gyógyszerek baktériumokra gyakorolt hatása korrelált az ismert antibiotikum-szerű mellékhatásokkal és kohorsz-adatokkal. Az antibiotikum- és gyógyszer-érzékenység fajok között összefüggött, ami közös rezisztencia-mechanizmusra utal. Felvetődik, hogy a nem antibiotikum-jellegű gyógyszerek is hozzájárulhatnak az antibiotikum-rezisztenciához.

[234] Routy B, Le Chatelier E, Derosa L et al. Gut microbiome influences efficacy of PD-1–based immunotherapy against epithelial tumors. Science. 2018. Link

A transzlációs vizsgálat azt mutatta ki, hogy a PD-1/PD-L1 immun-ellenőrzőpont-gátlókkal (ICI) szembeni primer rezisztencia előrehaladott daganatokban kóros bélmikrobiom-összetételhez köthető, és az antibiotikumok csökkentik az ICI klinikai előnyét. Az ICI-respondereitől származó FMT germ-free vagy antibiotikummal kezelt egerekben helyreállította a PD-1-blokád hatékonyságát; a nem reagálóké nem. A széklet-metagenomika az ICI-választ Akkermansia muciniphila feldúsulással hozta összefüggésbe. Orális A. muciniphila a nem reagálók FMT-je után IL-12-függő CCR9+CXCR3+CD4+ T-sejt-toborzással helyreállította a PD-1 hatékonyságát. A mikrobiom-moduláció adjuváns onkoimmunterápiás célpont.

[238] Dominguez-Bello MG, Costello EK, Contreras M et al. Delivery mode shapes the acquisition and structure of the initial microbiota across multiple body habitats in newborns. Proc Natl Acad Sci USA. 2010. Link

A vizsgálat 10 anya-újszülött párnál (4 hüvelyi, 6 császármetszéses) multiplex 16S rRNS-pyroszekvenálással jellemezte a baktériumközösségeket; az anyák bőr-, szájüregi és hüvelyi mintáit szülés előtt, az újszülött bőrét, szájüregét, garatváladékát és meconiumát 24 órán belül vették le. A szülésmód minden testhelyen erősen formálta az újszülöttkori mikrobiótát: a hüvelyi úton születettek közössége az anyai hüvelyi mikrobiótára hasonlított, míg a császáros újszülötteké az anyai bőrre. Az adatok igazolják a szülésmód alapozó hatását a kezdeti emberi mikrobiom kialakulására.

[300] Goodrich JK, Waters JL, Poole AC et al. Human genetics shape the gut microbiome. Cell. 2014. Link

A vizsgálat a TwinsUK kohorsz több mint 1000 székletmintáját — köztük 416 ikerpárt — elemezte a gazdaszervezet genetikájának bélmikrobiomra gyakorolt hatásának tesztelésére. Számos mikrobiális taxon abundanciája örökölhetőnek bizonyult, ezek közül legkiemelkedőbben a Christensenellaceae család, mely más örökölhető baktériumokkal és metanogén archeákkal alkotott együttes előfordulási hálózatot. A Christensenellaceae és partnerei alacsony testtömegindexű egyéneknél dúsultak. A vizsgálat populációszintű bizonyítékot ad arra, hogy a gazdaszervezet genetikája formálja a bélmikrobiomot és kölcsönhatásban van vele az anyagcsere-fenotípus befolyásolásában.

[306] Mirzayi C, Renson A, Genomic Standards Consortium et al. Reporting Guidelines for Human Microbiome Research: The STORMS Checklist. Nature Medicine. 2021. Link

A módszertani konszenzus multidiszciplináris mikrobiom-kutatók részvételével adaptálta a megfigyeléses és genetikai epidemiológiai bejelentési irányelveket a Strengthening The Organization and Reporting of Microbiome Studies (STORMS) eszközzé. A STORMS 17 tételes ellenőrzőlista, hat szekcióba szervezve a tipikus publikációs struktúra szerint, új elemekkel a tenyésztéstől független mikrobiom-vizsgálatok laboratóriumi, bioinformatikai és statisztikai elemzéseire. Az eszköz standardizált jelentési keretet ad, mely megkönnyíti a kéziratkészítést, a peer review-t, a megértést és a vizsgálatok összehasonlító elemzését.

[381] Househam AM, Peterson CT, Mills PJ, Chopra D. The effects of stress and meditation on the immune system, human microbiota, and epigenetics. Adv Mind Body Med. 2017. Link

Househam, Peterson, Mills és Chopra 2017-es Advances in Mind-Body Medicine áttekintése a stressz és meditáció immunrendszerre, humán mikrobiótára és epigenetikára gyakorolt hatásait vizsgálja. A szerzők szintetizálják a bizonyítékot: a krónikus pszichés stressz aktiválja a HPA-tengely kortizol-felszabadulását, autonóm-dysreguláció és proinflammatórikus citokin-termelést okoz, dokumentált diszbiotikus mikrobiom-változásokkal (csökkent Lactobacillus, Bifidobacterium, emelkedett patobionok). Ezzel szemben a meditáció — mindfulness, jóga, transzcendentális — hatást gyakorol a telomer-hosszra, DNS-metilációra, gyulladásos génexpresszióra és mikrobiom-összetételre. Az áttekintés bél-agy-immun-elme tengely keretrendszert támogat, és motivál meditációs intervenciós vizsgálatokat stresszhez kapcsolódó mikrobiom-zavarra.

[382] Zeb F, Wu X, Chen L et al. Effect of time-restricted feeding on metabolic risk and circadian rhythm associated with gut microbiome in healthy males. Br J Nutr. 2020. Link

A vizsgálat az időkorlátozott étkezés (TRF) hatását elemezte metabolikus markerekre, cirkadián ritmusra és bélmikrobiomra egészséges felnőtt férfiakon. A résztvevőket TRF (n=56) vagy non-TRF (n=24) csoportba osztották 25 napos protokollra. Vérvétel TRF előtt és után (TRF-csoport), illetve a 25. napon egyszer (non-TRF) történt. Szérum lipid- és májprofilt mértek; valós idejű PCR-rel cirkadián és gyulladásos génexpressziót elemeztek. A TRF javította a szérum lipidprofilt és a májmarkereket, a metabolikus előnyökkel egybehangzóan modulálta a cirkadián és gyulladásos génexpressziót, és bélmikrobiomhoz köthető ritmusváltozásokat eredményezett. Az eredmények a TRF-et nem-farmakológiai stratégiaként támogatják, amely az étkezési ablakot a cirkadián biológiához igazítva csökkenti a metabolikus kockázatot.

[402] Feuerstadt P, Louie TJ, Lashner B et al. SER-109, an Oral Microbiome Therapy for Recurrent Clostridioides difficile Infection. New England Journal of Medicine. 2022. Link

Ez a 3. fázisú randomizált klinikai vizsgálat (ECOSPOR III) az SER-109-et — tisztított Firmicutes-spórákból álló orális mikrobiom-terápiát — tesztelte legalább 3 CDI-epizódot (a kvalifikáló epizódot is beleértve) átélt felnőttekben. Standard antibiotikum-kezelés után a betegek SER-109-et vagy placebót kaptak (napi 4 kapszula 3 napon át). Belépéskor toxin-tesztelés kellett, és kor, valamint antibiotikum szerint rétegeztek. A primer hatékonysági végpont a 8 hetes CDI-relapszus csökkent kockázata volt. Az SER-109 szignifikáns előnyt mutatott placebóval szemben a tartós klinikai válasz tekintetében. Az elemzések dokumentálták a mikrobiom-beültetést és a spórás formulációval összhangban álló mikrobiális metabolit-eltolódásokat. A vizsgálat alátámasztotta az SER-109 (Vowst) FDA-engedélyét mint az első orális mikrobiom-terápia rekurrens CDI-re.

[476] Marotz CA, Sanders JG, Zuniga C et al. Improving Saliva Shotgun Metagenomics by Chemical Host DNA Depletion. Microbiome. 2018. Link

Gazdaszervezet-dominált orális minták shotgun metagenomikai szekvenálásának optimalizálására három kereskedelmi host-depletion kitet, méretszűrést és egy új ozmotikus lízis + propidium-monoazid (lyPMA) eljárást hasonlítottak össze humán nyálmintákon. A lyPMA bizonyult a leghatékonyabbnak: a gazda-DNS arány 89,29 ± 0,03%-ról 8,53 ± 0,10%-ra csökkent. Emellett a lyPMA-kezelt minták mutatták a legkisebb taxonómiai torzítást a kezeletlen kontrollhoz képest. A módszer javasolt a mikrobiális DNS dúsítására gazdadús orális mintákból metagenomikai vizsgálatokban.

[504] Gionchetti P, Rizzello F, Helwig U et al. Prophylaxis of pouchitis onset with probiotic therapy: a double-blind, placebo-controlled trial. Gastroenterology. 2003. Link

Gionchetti és munkatársai 2003-as Gastroenterology-cikke mérföldkő kettős-vak, placebokontrollált vizsgálat a VSL#3 probiotikum pouchitis-prevencióra colitis ulcerosa után végzett ileal pouch-anal anastomosis (IPAA) műtétben. 40 IPAA utáni CU-s beteget randomizáltak VSL#3-ra (négy Lactobacillus-, három Bifidobacterium- és Streptococcus thermophilus-törzset tartalmazó keverék) vagy placebóra egy évre. Pouchitis a VSL#3-csoport 10%-ánál, a placebóé 40%-ánál (p<0,05) jelentkezett. Az életminőség szignifikánsan jobb volt a probiotikum-csoportban. A vizsgálat A-szintű bizonyítékként pozicionálta a VSL#3-at pouchitis-megelőzésre az ECCO- és AGA-irányelvekben. A probiotikum klinikai hatékonyság alapreferenciája IBD-szövődményekben.

[505] Bin-Nun A, Bromiker R, Wilschanski M et al. Oral probiotics prevent necrotizing enterocolitis in very low birth weight neonates. J Pediatr. 2005. Link

≤1500 g súlyú újszülötteket randomizáltak vagy napi probiotikus táplálék-kiegészítésre (Bifidobacterium infantis, Streptococcus thermophilus, Bifidobacterium bifidus; 10^9 CFU/nap), vagy nem kaptak kiegészítést. A születési súly, gesztációs kor és teljes táplálás eléréséig eltelt idő nem különbözött a 72 vizsgálati és 73 kontroll-újszülött között. A nekrotizáló enterocolitis (NEC) gyakorisága szignifikánsan csökkent a probiotikus csoportban (4% vs. 16,4%; p=0,03), és a Bell-kritériumok szerinti súlyosság alacsonyabb volt (2,3 ± 0,5 vs. 1,3 ± 0,5; p=0,005). A profilaktikus probiotikum csökkenti a NEC előfordulását és súlyosságát nagyon kis súlyú újszülötteknél.

[506] Sokol H, Pigneur B, Watterlot L et al. Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients. Proc Natl Acad Sci USA. 2008. Link

A nyálkahártya-asszociált mikrobiótát Crohn-betegek (CD) műtéti reszekciója alatt és 6 hónappal később FISH-sel profilozták. A Faecalibacterium prausnitzii — a Firmicutes egyik fő tagja — csökkenése magasabb posztoperatív ileális CD-recidíva-rizikóval társult; a reszekált ileum-nyálkahártya alacsonyabb F. prausnitzii-szintje 6 hónapos endoszkópos recidívával is korrelált. In vitro és in vivo (TNBS-indukálta colitis) kísérletek bizonyították a F. prausnitzii gyulladáscsökkentő hatását. A faj potenciális biomarker a posztoperatív recidíva-rizikóra és terápiás jelölt CD-ben.

[507] Costello SP, Hughes PA, Waters O et al. Effect of fecal microbiota transplantation on 8-week remission in patients with ulcerative colitis: a randomized clinical trial. JAMA. 2019. Link

Egy multicentrikus, randomizált, kettős-vak vizsgálat három ausztrál centrumban 73 enyhe-mérsékelt aktivitású colitis ulcerosás felnőttet vont be. A betegek anaerob körülmények között elkészített, kevert donortól származó FMT-t (n=38) vagy autológ FMT-t (n=35) kaptak kolonoszkópián keresztül, majd két beöntést kaptak 7 nap alatt, 12 hónapos utánkövetéssel. Az anaerob széklet-feldolgozás célja a mikrobiális életképesség növelése volt, lehetővé téve hatékonyság elérését rövidebb, kevésbé intenzív FMT-vel. A vizsgálat alátámasztja az anaerob, rövid időtartamú FMT alkalmazását indukciós terápiaként aktív colitis ulcerosában.

[508] Camilleri, M. Diagnosis and treatment of irritable bowel syndrome: a review. JAMA. 2021. Link

Az irritábilis bél szindróma (IBS) az USA-ban a lakosság 7–16%-át érinti, leggyakrabban nőket és fiatalokat, és éves közvetlen költsége meghaladja az 1 milliárd USD-t. A diagnózis hagyományosan tünet-alapú. A konszenzusos tünet-alapú kritériumok validációja az alapvető tünetek (hasi fájdalom, székelési zavar, puffadás) egyszerűbb azonosítását és a riasztó tünetek (akaratlan súlyvesztés, rektális vérzés, közelmúltbeli székelési változás) kizárását támogatja. A diagnosztikai pontosságot javítja a részletes anamnézis, fizikális vizsgálat (digitális rektális vizsgálattal) és alap szűrővizsgálatok (hemoglobin, CRP) szervi betegség kizárására.

[510] Verdu EF, Galipeau HJ, Jabri B. Novel players in coeliac disease pathogenesis: role of the gut microbiota. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2015. Link

Több vizsgálat is jelzi, hogy a bélmikrobióta összetétele és funkciója megváltozik coeliakiában — ezek a változások a betegség kialakulása előtt vagy gluténmentes diéta alatt is fennmaradhatnak. A mikrobióta elősegítheti vagy enyhítheti a coeliakia-asszociált immunopatológiát. Az áttekintés összefoglalja a gazda-genetika, környezeti tényezők és bélmikrobióta szerepét a betegség patogenezisében, és hangsúlyozza az állatmodellek (gnotobiotikus technológia) és hosszú távú klinikai vizsgálatok jelentőségét az ok-okozati összefüggések tisztázásában, valamint a mikrobióta-moduláció mint terápiás vagy preventív stratégia értékelésében.

[511] Kostic AD, Chun E, Robertson L et al. Fusobacterium nucleatum potentiates intestinal tumorigenesis and modulates the tumor-immune microenvironment. Cell Host Microbe. 2013. Link

Fusobacterium spp.-t humán kolon-adenomákban a környező szövethez képest dúsabban találtak, valamint kolorektális adenomás és karcinómás betegek székletében az egészségesekhez képest. ApcMin/+ egérmodellben a F. nucleatum növelte a tumorok számát és szelektíven toborzott tumor-infiltráló mieloid sejteket, elősegítve a tumorprogressziót. A F. nucleatum-mal kitett egerek tumorai gyulladásos génmintázatot mutattak, amely a humán Fusobacterium-pozitív kolorektális karcinómákkal megegyező. Más kolorektális rákhoz társított baktériumokkal ellentétben a F. nucleatum nem súlyosbította a colitist vagy a gyulladás-asszociált karcinogenezist, ami önálló, mieloid-meghajtotta mechanizmust jelez.

[513] Davar D, Dzutsev AK, McCulloch JA et al. Fecal microbiota transplant overcomes resistance to anti-PD-1 therapy in melanoma patients. Science. 2021. Link

Egy klinikai vizsgálatban PD-1-refrakter melanomás betegeknél a reagáló-donor-eredetű FMT-t anti-PD-1-gyel kombinálták. A kombináció jól tolerált volt, 15 betegből 6-nak klinikai választ adott, és gyors, tartós mikrobiom-perturbációt indukált. A reagálóknál nőtt az anti-PD-1-választal korábban összefüggésbe hozott taxonok abundanciája, a CD8+ T-sejt-aktiváció és csökkent az IL-8-termelő mieloid sejtek aránya. Önálló proteomikai és metabolomikai mintázatok, valamint transzkingdom hálózati elemzések megerősítették, hogy a bélmikrobiom szabályozza ezeket az immunváltozásokat. Az FMT képes leküzdeni a PD-1-blokád-rezisztenciát melanomában.

[514] Walters WA, Xu Z, Knight R. Meta-analyses of human gut microbes associated with obesity and IBD. FEBS Lett. 2014. Link

Több kohorszt közös bioinformatikai pipeline-on át újra elemezve azonos IBD-mikrobióta-mintázat azonosítható, amely magas pontossággal osztályozza az IBD- és nem-IBD-egyéneket. Ezzel szemben az elhízás-jellegű minták nem voltak konzisztensek a vizsgálatok között, még harmonizált elemzéssel sem, bár az egyének sovány vs. elhízott osztályozása szignifikáns pontosságot ért el az egyes kohorszokon belül — összhangban a kísérleti fenotípus-átvitellel. Az eredmények szerint a kisebb effekt-méretű mikroba-állapot korrelációk (elhízás) más kohorsz- és elemzési stratégiát igényelnek, mint a nagyobbak (IBD).

[515] Vrieze A, Van Nood E, Holleman F et al. Transfer of intestinal microbiota from lean donors increases insulin sensitivity in individuals with metabolic syndrome. Gastroenterology. 2012. Link

Metabolikus szindrómás férfi recipienseket randomizáltak vékonybélbe végzett allogén (sovány donor) vagy autológ bélmikrobióta-infúzióra. Hat héttel a sovány donor infúzió után az inzulin-szenzitivitás nőtt (medián glükóz-eltűnési ráta: 26,2 → 45,3 μmol/kg/perc; p<0,05), és párhuzamosan emelkedett a butirát-termelő bélmikrobiota. A proof-of-concept vizsgálat alátámasztja a bélmikrobióta mint inzulin-szenzitivitást javító terápiás ágens fejlesztését.

[516] Aron-Wisnewsky J, Vigliotti C, Witjes J et al. Gut microbiota and human NAFLD: disentangling microbial signatures from metabolic disorders. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2020. Link

A bélmikrobióta-diszbiózis ismételten leírást nyer elhízásban és 2-es típusú diabéteszben, amelyek szorosan társulnak az alkoholmentes zsírmáj-betegséggel (NAFLD). Állatkísérletek alapján a bélmikrobiótának potenciális okozati szerepe van a NAFLD-ben. A humán vizsgálatok elkezdték azonosítani azokat a mikrobiom-mintázatokat, amelyek megkülönböztetik az egészséges egyéneket NAFLD-, NASH- vagy cirrózisos betegektől, de a metabolikus zavaró tényezőket nem mindig veszik figyelembe. A heterogén léziók, demográfiai változékonyság és eltérő szekvenálási/diagnosztikai módszerek magyarázhatják az eltérő eredményeket, ami standardizált, jól kontrollált jövőbeli vizsgálatokat tesz szükségessé.

[517] Stiemsma LT, Reynolds LA, Turvey SE, Finlay BB. The hygiene hypothesis: current perspectives and future therapies. ImmunoTargets Ther. 2015. Link

A fejlett országokban az atópiás és immun-diszregulációs betegségek az 1980-as évek óta folyamatosan gyakoribbá váltak, párhuzamosan a fertőző betegségek csökkenésével. Az eredeti „higiénia-hipotézist" (Strachan 1989) az elmúlt évtizedben „mikroflóra-" és „régi barátok-" hipotézisekké bővítették, amelyek a kommenzális mikrobiótát és parazita helminteket a normál immunfejlődéssel kapcsolják össze. A jelenlegi bizonyítékok alátámasztják, hogy a bélmikrobióta manipulálása atópiás betegség, IBD és 1-es típusú diabétesz kezelésére vagy megelőzésére alkalmas, és kiemelik az emberi immunrendszer és a mikrobiális/parazita partnerek koevolúcióját.

[518] Parodi A, Paolino S, Greco A et al. Small intestinal bacterial overgrowth in rosacea: clinical effectiveness of its eradication. Clin Gastroenterol Hepatol. 2008. Link

113 egymást követő rosaceás ambuláns betegen (31 férfi / 82 nő; átlagéletkor 52 ± 15 év) és 60 nemben és életkorban illesztett egészséges kontrollon laktulóz- és glükóz-kilégzési teszttel vizsgálták a vékonybél-baktérium-túlnövekedést (SIBO). A SIBO-pozitív betegeket randomizálták rifaximin 1200 mg/nap 10 napig vagy placebo karra; egy SIBO-negatív alcsoport is kapott rifaximint. Az eradikációt 1 hónappal a kezelés után értékelték. A vizsgálat alátámasztja a SIBO és rosacea klinikailag releváns társulását, valamint a rifaximin-eradikáció hatékonyságát a rosacea tüneteinek javításában.

[519] Kang DW, Adams JB, Coleman DM et al. Long-term benefit of Microbiota Transfer Therapy on autism symptoms and gut microbiota. Sci Rep. 2019. Link

Egy 18 résztvevős Microbiota Transfer Therapy (MTT) — antibiotikum, bélmosás, gyomorsav-szuppresszor és FMT kombinációja — 2 éves nyílt utánkövetése autizmus spektrum zavaros (ASD) gyermekeknél. A gasztrointesztinális javulás nagy része fennmaradt, és az autizmushoz társuló tünetek a kezelés után tovább javultak. A kulcs mikrobióta-változások (szignifikánsan emelkedett baktérium-diverzitás, valamint magasabb Bifidobacterium- és Prevotella-arány) az utánkövetésig megmaradtak. Az eredmények alátámasztják az FMT-alapú MTT tartós biztonságosságát és előnyeit ASD-ben.

[520] Sampson TR, Debelius JW, Thron T et al. Gut microbiota regulate motor deficits and neuroinflammation in a model of Parkinson's disease. Cell. 2016. Link

α-szinuklein-túltermelő Parkinson-egérmodellben a bélmikrobióta szükséges volt a motoros tünetek, mikroglia-aktiváció és α-szinuklein-patológia kialakulásához. Az antibiotikum-kezelés enyhítette, a mikrobiális re-kolonizáció pedig elősegítette a patofiziológiát felnőtt állatokban — vagyis a posztnatális bél-agy jelátvitel modulálja a betegséget. Specifikus mikrobiális metabolitok orális adása csíramentes egereknek neuroinflammációt és motoros tüneteket indukált. Az eredmények funkcionális kapcsolatot teremtenek a bélbaktériumok és szinukleinopátiák között, és a mikrobiota-célzott beavatkozást terápiás stratégiaként javasolják Parkinson-kórban.

[521] Liu RT, Walsh RFL, Sheehan AE. Prebiotics and probiotics for depression and anxiety: a systematic review and meta-analysis of controlled clinical trials. Neurosci Biobehav Rev. 2019. Link

34 kontrollált klinikai vizsgálat random-effekt meta-analízise értékelte a pre- és probiotikumok hatását a depresszióra és szorongásra. A prebiotikumok nem különböztek a placebótól depresszió (d=-0,08; p=0,51) vagy szorongás (d=0,12; p=0,11) terén. A probiotikumok kicsi, de szignifikáns hatást mutattak depresszióban (d=-0,24; p<0,01) és szorongásban (d=-0,10; p=0,03). A mintatípus moderálta a probiotikus depresszió-hatást: klinikai/orvosi mintákban nagyobb (d=-0,45; p<0,001), mint közösségi mintákban; pszichiátriai mintákra korlátozott előzetes elemzés közepes-erős hatást adott (d=-0,73; p<0,001).

[522] Dominy SS, Lynch C, Ermini F et al. Porphyromonas gingivalis in Alzheimer's disease brains: evidence for disease causation and treatment with small-molecule inhibitors. Sci Adv. 2019. Link

A Porphyromonas gingivalis — krónikus parodontitis kulcs-patogénje — és toxikus gingipain-proteázai Alzheimer-kóros (AD) agyban kimutathatók, a gingipain-szint tau- és ubikvitin-patológiával korrelál. Orális P. gingivalis-fertőzés egerekben kolonizálta az agyat és növelte az Aβ1-42 termelést. A gingipainek in vitro és in vivo neurotoxikusak, károsítják a taut. Kismolekulájú gingipain-inhibitorok csökkentették az agyi P. gingivalis-terhelést, gátolták az Aβ1-42 termelést, mérsékelték a neuroinflammációt és megmentették a hippocampális neuronokat — alátámasztva a gingipain-gátlást mint terápiás stratégiát AD-ben.

[523] Scher JU, Sczesnak A, Longman RS et al. Expansion of intestinal Prevotella copri correlates with enhanced susceptibility to arthritis. eLife. 2013. Link

A rheumatoid arthritis (RA) szisztémás autoimmun betegség, amelyet genetikai és környezeti tényezők hajtanak. A szerzők 16S-szekvenálást végeztek 114 székletmintán (RA-betegek és kontrollok), kiegészítve 44 mintán shotgun szekvenálással. A Prevotella copri erős korrelációt mutatott az új-onsetű, kezeletlen RA-val (NORA); a növekvő Prevotella-abundancia csökkent Bacteroides-szel és néhány előnyösnek tartott mikroba elvesztésével társult. Egyedi Prevotella-gének is korreláltak a betegséggel. Az eredmények a P. copri terjeszkedését köthetik a korai RA patogeneziséhez, és mikrobiota-alapú biomarkereket és terápiás célpontokat sejtetnek.

[524] Vaziri ND, Yuan J, Khazaeli M et al. Disintegration of colonic epithelial tight junction in uremia. Am J Nephrol. 2013. Link

Patkány CKD-modellben (0,7% adenin-tartalmú táp 2 hétig) szájon át adagolt aktív szén-készítményt (AST-120; 4 g/kg/nap 2 hétig) teszteltek azon hipotézis alapján, hogy az ureát és ureából származó ammóniát adszorbeálja, és így mérsékli a CKD-indukálta bélepitél-barrier-károsodást és szisztémás gyulladást. A CKD rontja a bélbarrier-funkciót, ami toxikus termékek szisztémás bejutását teszi lehetővé. A vizsgálat alátámasztja az AST-120 alkalmazását a tight junction-ok megőrzésére és a szisztémás gyulladás csökkentésére CKD-ben, a bél kémiai környezetének módosításával.

[525] Pasini E, Aquilani R, Testa C et al. Pathogenic gut flora in patients with chronic heart failure. JACC Heart Fail. 2016. Link

60 stabil, jó tápláltsági állapotú krónikus szívelégtelen (CHF) betegnél (NYHA I–II n=30; NYHA III–IV n=30) és 20 illesztett egészséges kontrollon székletbaktérium- és gombatenyésztést (Candida), bélpermeabilitást (cellobióz-cukor teszt), echokardiográfiás jobb pitvari nyomást (RAP) és CRP-szintet mértek. A vizsgálat összefüggést mutat a patogén bélflóra és a bélpermeabilitás, a betegség súlyossága, vénás vérpangás és gyulladás között CHF-ben, alátámasztva, hogy a bélflóra-transzlokáció hozzájárul a szisztémás gyulladáshoz CHF-ben.

[526] Anand S, Mande SS. Diet, microbiota and gut-lung connection. Front Microbiol. 2018. Link

A bélmikrobióta befolyásolja a metabolikus és immun-homeosztázist. Az étrend a mikrobióta-összetétel és a termelt metabolitok kulcsmeghatározója; ezek modulálják a gasztrointesztinális immunitást és hatnak távoli szervekre, mint a tüdő és az agy. A bélbaktériumok mikroaspirációja és a szenzitizált immunsejtek nyirok-/vér-úti vándorlása szintén alakíthatja a szervspecifikus immunválaszt. A diszbiózis szerepet játszik tüdőbetegségekben — allergia, asztma, cisztás fibrózis — alátámasztva a bél-tüdő tengelyt mint terápiás célpontot légúti betegségekben.

[541] Knight R, Vrbanac A, Taylor BC et al. Best practices for analysing microbiomes. Nat Rev Microbiol. 2018. Link

Best-practice áttekintés a mikrobiom-vizsgálatok tervezéséhez, molekuláris technológiaválasztáshoz, adatfeldolgozáshoz és multi-omikai integrációhoz. A szerzők az exakt szekvencia-variánsok (ASV) alkalmazását ajánlják az OTU-alapú elemzésekkel szemben; tárgyalják a metagenomikai és metabolomikai adatok integrálásának módszereit; és kitérnek a kompozicionális adatelemzésre, ahol a fejlődés különösen gyors. A klasszikus kísérlettervezési és reprodukálhatósági szempontok továbbra is kritikusak. Ezek figyelembevétele mélyebb betekintést tesz lehetővé a mikrobiom-adatbázisok mind humán, mind környezeti kontextusban való elemzésébe.

[542] McDonald D, Hyde E, Debelius JW et al. American Gut: an Open Platform for Citizen Science Microbiome Research. mSystems. 2018. Link

Az American Gut Project több mint 10 000 polgári-tudós székletmintát hasonlított össze az Earth Microbiome Project standardizált protokolljaival (USA, Egyesült Királyság, Ausztrália) környezeti mintákkal. A humán székletminták váratlanul széles béta-diverzitást mutattak a környezetiekhez képest. A nyílt adat-integráció új molekulák és nem-célzott metabolomikai asszociációk feltárását tette lehetővé a sokszínű növényfogyasztással kapcsolatban (jobb prediktor, mint a redukcionista kategóriák, pl. veganizmus). A munka igazolja a postán küldött, önállóan gyűjtött mikrobiom-minták megfelelőségét ismert asszociációk reprodukálására és új asszociációk feltárására, beleértve pszichiátriai betegségeket és egyéni perturbációkat (pl. műtét).

[543] Allaband C, McDonald D, Vázquez-Baeza Y et al. Microbiome 101: Studying, Analyzing, and Interpreting Gut Microbiome Data for Clinicians. Clin Gastroenterol Hepatol. 2019. Link

Klinikus-orientált áttekintés a mikrobiom-tartalomról, az egyének közötti és egyéneken belüli variabilitásról, a tanulmánytervezési szempontokról és zavaró tényezőkről, valamint a laboratóriumi és számítógépes módszerekről a mikrobiota, génproduktumok és metabolitok leolvasásához. Klinikusoknak fontos buktatókat emel ki: az egyén mikrobiomának tévesnek tartott stabilitása; az étrend gyors, az egyének közötti különbségekhez képest nagy változásokat indukáló mítosza; egyetlen közös székletmikrobiom létezésének feltételezése; és az a hit, hogy minden lab/bioinformatika-pipeline ugyanazt az eredményt adja. A jelenlegi korlátok és jövőbeli ígéretek megértése elengedhetetlen a rutin klinikai alkalmazáshoz.

[545] Walsham NE, Sherwood RA. Fecal calprotectin in inflammatory bowel disease. Clin Exp Gastroenterol. 2016. Link

Az IBD és IBS sok klinikai tünetet megoszt, ezért a pontos diagnózis lényeges, mivel az IBD-terápia gyorsan fejlődik, míg az IBS-t főleg tüneti alapon kezelik. A klinikai értékelés, képalkotás és endoszkópia régóta a diagnosztika alappillére. Az elmúlt évtizedben a gasztrointesztinális gyulladás székletbiomarkerei — mindenekelőtt a kalprotektin, egy neutrofil-citoszolikus fehérje — bekerültek a rutinhasználatba. A kalprotektin objektív értékelést tesz lehetővé a betegség aktivitásáról és a kezelésre adott válaszról a Crohn-betegség és colitis ulcerosa krónikus, remittáló-relabáló lefolyásában.

[546] Scheffler L, Crane A, Heyne H et al. Widely Used Commercial ELISA Does Not Detect Precursor of Haptoglobin2, but Recognizes Properdin as a Potential Second Member of the Zonulin Family. Front Endocrinol. 2018. Link

A szerzők kimutatták, hogy a széles körben használt kereskedelmi zonulin-ELISA nem a pre-haptoglobin-2-t (a „valódi” zonulint) méri: tömegspektrometriás azonosítás szerint a kit a komplement C3-mal és a properdinnel (komplement faktor P) reagál, nem a pre-HP2-vel. Ez megkérdőjelezi a kittel kapott zonulin-értékek érvényességét mint bélbarrier-marker.

[547] Rezaie A, Buresi M, Lembo A et al. Hydrogen and methane-based breath testing in gastrointestinal disorders: The North American Consensus. Am J Gastroenterol. 2017. Link

Öt területre kiterjedő (indikáció, előkészítés, kivitelezés, eredményértékelés, ismeret-hiányok) találkozó-előtti kérdőívet küldtek 17 klinikus-kutatónak; 10 vett részt az élő ülésen. Bizonyíték-alapú megközelítéssel 28 állítást véglegesítettek és anonim szavazás után 26-ban értek el konszenzust mind az öt területen. Az iránymutatás célja a szénhidrát-maldigesztiós szindrómákat és a vékonybél-baktériumtúlnövekedést (SIBO) értékelő kilégzési tesztek indikációinak, módszertanának és értékelésének standardizálása.

[548] Eisenhofer R, Minich JJ, Marotz C, Cooper A, Knight R, Weyrich LS. Contamination in Low Microbial Biomass Microbiome Studies: Issues and Recommendations. Trends Microbiol. 2019. Link

A mikrobiom-kutatásban a következő-generációs szekvenálás magas érzékenységgel képes közösségfelmérést végezni, ugyanakkor hatékonyan detektálja a kontamináns DNS-t és keresztszennyeződést is, különösen alacsony biomasszájú minták esetén. A szerzők áttekintik a kontamináció forrásait és hatásait, és azonosítják a kulcsfontosságú megelőző intézkedéseket. Javasolnak egy minimum-kritérium-listát, a „RIDE"-t, a jövőbeli alacsony-biomasszájú vizsgálatok érvényességének javítására — reagens- és műszerkontrollok, belső kontamináció-követés, DNS-hígítási sorok és kísérleti pozitív kontrollok elvárásaival.

[549] Karstens L, Asquith M, Davin S et al. Controlling for Contaminants in Low-Biomass 16S rRNA Gene Sequencing Experiments. mSystems. 2019. Link

Ugyanaz az adatcsomag, mint a ref-471: mintaközösség-hígítási sor négy számítógépes dekontaminálási módszerrel (negatív-kontroll-szűrés, abundancia-szűrés, Decontam, SourceTracker). A kontamináns-DNS arány a biomassza csökkenésével nőtt — a legjobban hígított mintában 80,1%-ot ért el. A benchmark támogatja a bioinformatikai dekontamináció-eltávolító pipeline-ok kiválasztását, különösen az alacsony-biomasszájú minták esetén, ahol az in silico módszereknek természetszerű korlátai vannak.

[558] Kennedy KM, de Goffau MC, Perez-Muñoz ME et al. Questioning the fetal microbiome illustrates pitfalls of low-biomass microbial studies. Nature. 2023. Link

A szerzők reprodukciós-biológiai, mikrobiális-ökológiai, bioinformatikai, immunológiai, klinikai-mikrobiológiai és gnotobiológiai szempontból értékelik a magzati és intrauterin mikrobiális kolonizációt állító közelmúltbeli vizsgálatokat. Konklúziójuk szerint a detektált mikrobiális jelek valószínűleg mintavételi, DNS-kivonási vagy szekvenálási kontaminációból származnak. Élő, replikálódó mikrobiális populációk létezése egészséges magzati szövetben összeegyeztethetetlen a megalapozott immunológiai, klinikai-mikrobiológiai és csíramentes-emlős-leszármaztatási elvekkel. A magzati mikrobiom intő példa az alacsony-biomasszájú szekvenálás buktatóira és a transz-diszciplináris megközelítés szükségességére.

[559] Drossman DA, Hasler WL. Rome IV — Functional GI Disorders: Disorders of Gut-Brain Interaction. Gastroenterology. 2016. Link

Drossman és Hasler 2016-os Gastroenterology-cikke vezeti be a Rome IV-et — a funkcionális GI-rendellenességek Róma-diagnosztikai kritériumainak nagy revízióját, mostantól 'Bél-Agy Interakció Zavaraiként' (Disorders of Gut-Brain Interaction) átkeretezve. Az új keret integrálja a biopszichoszociális, mikrobióta-bél-agy tengely és viszcerális túlérzékenység koncepciókat, lecserélve a régebbi 'funkcionális' címkét mechanizmus-tudatos terminológiára. A cikk vázolja a diagnosztikai kritériumok frissítését IBS-re, funkcionális dyspepsiára, funkcionális székrekedésre/hasmenésre, hasi fájdalomra és más zavarokra, módosított tüneti gyakoriság-küszöbökkel és altípus-definíciókkal. A Rome IV a funkcionális GI/DGBI-diagnózis operatív referenciája világszerte.

[560] Thomas RL, Jiang L, Adams JS et al. Vitamin D Metabolites and the Gut Microbiome in Older Men. Nat Commun. 2020. Link

567 idősebb férfi keresztmetszeti elemzése: a magasabb aktív 1,25(OH)₂-D-szint a butirát-termelő baktériumok (köztük a Faecalibacterium) nagyobb abundanciájával és nagyobb mikrobiális diverzitással járt együtt. Az ok-okozati irány nem állapítható meg, de a pozitív összefüggés humán adatokon igazolt.

[561] Hill C, Guarner F, Reid G et al. The International Scientific Association for Probiotics and Prebiotics consensus statement on the scope and appropriate use of the term probiotic. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2014. Link

Az ISAPP szakértői panelje 2013 októberében áttekintette a probiotikum-területet az eredeti FAO/WHO-definíció után 13 évvel. A panel megerősítette, hogy az FAO/WHO-definíció — „élő mikroorganizmusok, amelyek megfelelő mennyiségben beadva egészségügyi előnyt biztosítanak a gazdaszervezet számára" — továbbra is releváns és kellően tág a jelenlegi és jövőbeli alkalmazásokhoz. A FAO/WHO Szakértői Konzultációs Jelentés és az Útmutató közötti ellentmondásokat a tudomány és alkalmazás fejlődésének fényében tisztázták. A konszenzusos állásfoglalás a „probiotikum" kifejezés pontosabb használatát szorgalmazza, hogy segítse a klinikusokat és fogyasztókat a piaci termékek megkülönböztetésében.

[562] Su GL, Ko CW, Bercik P et al. AGA Clinical Practice Guidelines on the Role of Probiotics in the Management of Gastrointestinal Disorders. Gastroenterology. 2020. Link

Su, Ko, Bercik és munkatársai 2020-as Gastroenterology-cikke az American Gastroenterological Association (AGA) Klinikai Gyakorlati Irányelveit közli a probiotikumok szerepéről GI-rendellenességek kezelésében. A szakértői panel áttekintette a bizonyítékokat pouchitisre, Clostridioides difficile-fertőzésre, antibiotikum-asszociált hasmenésre, IBS-re, IBD-re, akut fertőző gastroenteritisre (felnőttek és gyermekek) és nekrotizáló enterokolitiszre. Az irányelv feltételesen ajánlja a probiotikumokat válogatott indikációkra (pouchitis-prevenció: VSL#3; nekrotizáló enterokolitisz-megelőzés: Lactobacillus + Bifidobacterium kombináció), és ellenzi IBS-re, IBD-indukcióra/fenntartásra és felnőttkori akut fertőző gastroenteritisre elégtelen bizonyíték miatt. AGA bizonyíték-alapú probiotikum-referencia.

[563] Gibson GR, Hutkins R, Sanders ME et al. Expert consensus document: The International Scientific Association for Probiotics and Prebiotics (ISAPP) consensus statement on the definition and scope of prebiotics. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2017. Link

Az ISAPP szakértői panelje 2016 decemberében felülvizsgálta és frissítette a prebiotikum-definíciót. Az eredeti koncepcióval összhangban a frissített definíció szerint a prebiotikum „olyan szubsztrát, amelyet a gazda-mikroorganizmusok szelektíven hasznosítanak egészségügyi előny mellett". A kibővített definíció lehetővé teszi nem-szénhidrát szubsztrátok, a gasztrointesztinális rendszeren kívüli alkalmazás és nem-élelmiszer kategóriák megengedését; a szelektív mikrobiota-mediált mechanizmus követelménye megmarad. A bizonyított egészségügyi előny dokumentálása követelmény, és a definíció humán és állati prebiotikumokra egyaránt érvényes.

[564] Salminen S, Collado MC, Endo A et al. The International Scientific Association of Probiotics and Prebiotics (ISAPP) consensus statement on the definition and scope of postbiotics. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2021. Link

Az ISAPP 2019-es panelje felülvizsgálta a növekvő mértékben használt, de következetlenül definiált „posztbiotikum" kifejezést. A definíció szerint a posztbiotikum „életképtelen mikroorganizmusok és/vagy azok komponenseinek olyan készítménye, amely egészségügyi előnyt biztosít a gazdaszervezet számára". A hatékony posztbiotikumnak inaktivált mikrobiális sejteket vagy sejt-komponenseket kell tartalmaznia, metabolitokkal vagy anélkül, amelyek az észlelt egészségügyi előnyhöz hozzájárulnak. A panel értékelte a meglévő bizonyítékokat, javasolt hatásmechanizmusokat, szükséges bizonyíték-szinteket, biztonsági szempontokat és érdekelt-féli következményeket.

[565] Wilson BC, Vatanen T, Cutfield WS, O'Sullivan JM. The Super-Donor Phenomenon in Fecal Microbiota Transplantation. Front Cell Infect Microbiol. 2019. Link

Az FMT erősen hatékony visszatérő Clostridium difficile-fertőzésben, de a krónikus diszbiózis-asszociált betegségekben mutatott hatékonysága mérsékelt és változó. Több vizsgálat is jelzi, hogy az FMT-kimenetel a donorszéklet mikrobiális diverzitásától és összetételétől függ, ami a FMT-„szuperdonor" fogalmához vezetett. Az áttekintés a kulcsfajokat (keystone) vizsgálja FMT-siker prediktoraként, és tárgyalja, hogy a gazda-genetika és étrend hogyan befolyásolja az engraftmentet és fenntartást — keretet adva a célzottabb, donor-stratifikált baktérium-terápiához.

[588] Ahmed S, Spence JD. Mediterranean diet, the gut microbiome and meditation: a systematic review. Nutrients. 2022. Link

Az étrend és fizikai aktivitás egyaránt alakítja a bélmikrobiótát, egészségügyi következményekkel. Az áttekintés összefoglalja, hogyan változtatja meg a nyugati, ketogén, vegán, gluténmentes és mediterrán étrend, valamint az intenzív, állóképességi és aerob testmozgás a mikrobióta-összetételt és -funkciót. Számos tényező — nem, életkor, életmód, gyógyszeres terápia — szintén befolyásolja a mikrobiótát, kapcsolva azt betegségekhez és immunzavarokhoz. Az étrend–mikrobiota és testmozgás–mikrobiota kölcsönhatások cselekvő stratégiát kínálnak kardiovaszkuláris, neuroendokrin, légúti és vázizomzati betegségek megelőzésére és kezelésére.

[592] Mutlu EA, Comba IY, Cho T et al. Inhalational exposure to particulate matter air pollution alters the composition of the gut microbiome. Environ Pollut. 2018. Link

C57BL/6 egereket koncentrált környezeti részecskeszennyezésnek (PM) vagy szűrt levegőnek tettek ki napi 8 órán át, heti 5 napon, 3 héten keresztül inhalációs úton. Az expozíció után gasztrointesztinális szöveteket és székletet gyűjtöttek, és vizsgálták a bélmikrobiótát. A modell azt vizsgálja, hogyan változtatja meg a PM — közvetlenül lerakódva, vagy közvetve nyálkáslicsapás és nyál-/nyák-lenyelés révén — a bélepitéliumot és mikrobiótát. Az eredmények összekapcsolják a belélegzett légszennyezést a bélmikrobiom-változásokkal, és alátámasztják a légút-bél tengelyt mint mechanizmust, amelyen keresztül a környezeti PM gasztrointesztinális betegségekhez hozzájárulhat.

[593] Duan H, Yu L, Tian F et al. Gut microbiota: A target for heavy metal toxicity and a probiotic protective strategy. Sci Total Environ. 2020. Link

A nehézfém-expozíció (HM) hozzájárulhat a metabolikus betegségek progressziójához a bélmikrobiota zavarán keresztül. Az áttekintés bemutatja a kétirányú kapcsolatot: a HM-ek megváltoztatják a bélmikrobióta összetételét és funkcióját, miközben a bélbaktériumok befolyásolják a HM-felvételt és -metabolizmust fizikai gát-, pH- és oxidatív-egyensúly-modulálás, valamint detoxifikációs enzimek és fém-transzporterek expressziójának megváltoztatása révén. A bélmikrobióta a bélbarrier-integritást is befolyásolja, közvetve a HM-felszívódásra hatva. Az áttekintés tárgyalja a probiotikus stratégiákat — a bélbeli HM-megkötés fokozása, a HM-ek detoxifikálása, a fém-transzporter-expresszió modulálása és a barrier-funkció fenntartása — mint védő megközelítéseket a HM-indukálta diszbiózis ellen.

[599] Bokulich NA, Chung J, Battaglia T et al. Antibiotics, birth mode, and diet shape microbiome maturation during early life. Sci Transl Med. 2016. Link

43 amerikai csecsemő bélmikrobióta-fejlődését követték az élet első két évében. A korai expozíciók — antibiotikum-használat, császármetszés és tápszeres táplálás — összefüggésben álltak az anyai baktériumok átadásának zavarával, késleltetett mikrobióta-érlelődéssel és megváltozott α-diverzitással. Az eredmények rámutatnak a korai mikrobióta-érés komplexitására és a gyakori perturbációkkal szembeni érzékenységére ebben a kritikus neonatális ablakban — ami releváns a hosszú távú immun- és metabolikus rizikóra.

[600] Imhann F, Bonder MJ, Vich Vila A et al. Proton pump inhibitors affect the gut microbiome. Gut. 2016. Link

PPI-használat és bélmikrobióta-összetétel kapcsolatát 1815 alanyon három kohorszban vizsgálták 16S-szekvenálással. A PPI-használókat összevetették nem-használókkal kohorszonként és meta-analízissel. A PPI-k a világ 10 legtöbbet használt gyógyszere közé tartoznak, és emelt enterális fertőzés-rizikóval, főleg Clostridium difficile-vel asszociálódnak. A vizsgálat megerősíti, hogy a PPI-használat olyan irányba módosítja a bélmikrobiom-összetételt, amely ronthatja a kolonizációs ellenállást — mechanikus alátámasztást nyújtva a PPI–enterális-fertőzés epidemiológiai összefüggéshez.

[601] Targownik LE, Fisher DA, Saini SD. AGA Clinical Practice Update on De-Prescribing of Proton Pump Inhibitors: Expert Review. Gastroenterology. 2022. Link

Egy klinikai frissítés Best Practice Advice-állásfoglalásokat ad PPI-deprescriptionhez ambuláns betegeknél. A PPI-k a leggyakrabban felírt gyógyszerek közé tartoznak, és növekvő mértékben alkalmazzák bizonytalan haszonnal járó indikációkra, ami polifarmáciához és gazdasági teherhez vezet. A PPI-használathoz egyre több PPI-asszociált nemkívánatos eseményt (PAAE) társítanak. Az iránymutatás strukturált deprescripció-stratégiákat ajánl a tablettaszám, valós költség és elméleti rizikó csökkentésére, miközben fenntartja a megfelelő indikációval rendelkező betegek terápiáját.

[605] Plottel CS, Blaser MJ. Microbiome and malignancy. Cell Host Microbe. 2011. Link

Megmagyarázatlan, hogy a karcinogén-expozíciónak kitett vagy genetikailag fogékony egyének közül miért csak egyesek betegednek meg rákban. A klasszikus tényezőkön túl az emberi mikrobiom — baktériumok, archeák, eukarióták és vírusok, amelyek születésünktől kolonizálnak — modulátorként emelkedett ki. Az áttekintés három példán keresztül mutatja be a mikrobiom-asszociált malignitás elveit és paradigmáit: a mikrobiota hatása helyi és szomszédos neoplasztikus folyamatokra, az „estrobolom" modell a hormonfüggő rákok távoli hormon-effekturáról, valamint a mikrobiom és egy látens vírus komplex interakciója, amely malignitáshoz vezet.

[609] Berg G, Rybakova D, Fischer D et al. Microbiome definition re-visited: old concepts and new challenges. Microbiome. 2020. Link

Az EU MicrobiomeSupport projekt keretében nemzetközi szakértői panel (mintegy 40 vezető szakember, több mint 100 online felmérési résztvevővel) foglalkozott a „mikrobiom" kifejezés közösen elfogadott definíciójának hiányával. A közlemény Whipps és munkatársai 1988-as tömör, átfogó leírásán alapuló definíciót javasol, kiegészítve a legújabb technológiai és kutatási fejleményeket tükröző ajánlásokkal. A best practice-konszenzus és világosabb fogalmi keret célja a mikrobiom-kutatás harmonizálása a különböző szakterületek között.

[610] Sender R, Fuchs S, Milo R. Revised estimates for the number of human and bacteria cells in the body. PLoS Biol. 2016. Link

Az emberi testben jelen lévő sejtszámok publikált értékei nagyságrendekkel térnek el, és csak ritkán támasztják alá mérések. A szerzők a legfrissebb információk integrálásával 3,8·10^13-ra becsülik a 70 kg-os „referencia-ember" összes baktériumszámát. Az emberi sejtek számát 3,0·10^13-ra teszik, amelyben a hematopoetikus vonal dominál (kb. 90%). A széles körben idézett 10:1 baktérium–humánsejt arányt felülvizsgálják: a baktériumok és humán sejtek száma azonos nagyságrendű, a teljes baktérium-tömeg kb. 0,2 kg.

[612] Earle KA, Billings G, Sigal M et al. Quantitative imaging of gut microbiota spatial organization. Cell Host Microbe. 2015. Link

A szerzők bemutatják a BacSpace szoftvercsomagot és egy képi pipeline-t a bélmikrobióta térbeli szerveződésének nagy átbocsátóképességű kvantifikálására fixált bél-keresztmetszetek immunfluoreszcens képein. Gnotobiotikus és humán mikrobiótával kolonizált egereken alkalmazva a mikrobiótához hozzáférhető szénhidrátok (MAC-ok) eltávolítása vékonyítja a disztális kolon nyákréteget, növeli a mikrobák hámhoz való közelségét és a REG3β gyulladásos marker expresszióját. A MAC-szegény étrend a monofiletikus térbeli klaszterezést is megváltoztatja. A megközelítés más kontextusokban is használható (pl. Helicobacter pylori invázió egér gyomormirigyekbe), és lehetővé teszi a gazda-mikrobiota interakció téri-funkcionális vizsgálatát.

[613] Smith PM, Howitt MR, Panikov N et al. The microbial metabolites, short-chain fatty acids, regulate colonic Treg cell homeostasis. Science. 2013. Link

A szerzők a kolikus Foxp3+ regulátoros T-sejtek (Treg-ek) szabályozását vizsgálták, amelyek a bélgyulladást kontrollálják. A bélmikrobióta által termelt rövid szénláncú zsírsavak (SCFA-k) szabályozzák a kolikus Treg-állomány méretét és funkcióját, és Ffar2-függő módon véddenek a colitis ellen egerekben. Az eredmények szerint a mikrobiális metabolitok e bőséges osztálya a mikrobiom és az adaptív immunitás közötti koadaptáció egyik mechanizmusa, amely támogatja a kolon homeosztázist és molekuláris alapot szolgáltat az SCFA-alapú IBD-intervenciókhoz.

[615] Atarashi K, Tanoue T, Oshima K et al. Treg induction by a rationally selected mixture of Clostridia strains from the human microbiota. Nature. 2013. Link

Egy egészséges humán székletmintából kiindulva szelekciós lépéssorozattal 17 olyan baktériumtörzset izoláltak az emberi indigén mikrobiótából, amelyek erősen indukálják a CD4+FOXP3+ regulátoros T-sejteket (Treg) és gyulladáscsökkentő mediátorokat (IL-10, ICOS) kolonizált csíramentes egerekben. Genomszekvenálás szerint mind a 17 törzs a Clostridia IV, XIVa és XVIII klaszterébe esik, amelyekben nincsenek jelentős toxinok és virulenciafaktorok. A munka racionális, definiált-konzorcium-alapú stratégiát ad immunmoduláló probiotikumok fejlesztéséhez allergiás és gyulladásos betegségekben.

[617] Lindell AE, Zimmermann-Kogadeeva M, Patil KR. Multimodal interactions of drugs, natural compounds and pollutants with the gut microbiota. Nat Rev Microbiol. 2022. Link

Az áttekintés a bélbaktériumok és xenobiotikumok (antibiotikumok, gazdaszervezet-célpontú gyógyszerek, természetes táplálék-komponensek, élelmiszer-adalékok és környezeti szennyezők) közötti interakciók mechanizmusait foglalja össze. Az étrenden túl a kis molekulájú gyógyszerek és más xenobiotikumok jelentős hatást gyakorolnak a bélmikrobióta összetételére és funkciójára, ami befolyásolja a gyógyszer-metabolizmust, immunmodulációt és betegségrizikót. E kétirányú kölcsönhatások megértése elengedhetetlen a személyre szabott orvosláshoz és a környezeti expozíciók értékeléséhez.

[619] Mishra A, Lai GC, Yao LJ et al. Microbial exposure during early human development primes fetal immune cells. Cell. 2021. Link

A magzati immun-priminget magzati szervek 16S rRNS-szekvenálásával vizsgálták. Alacsony, de konzisztens mikrobiális jeleket detektáltak a magzati bélben, bőrben, placentában és tüdőben a 2. trimeszterben. Több élő baktériumtörzset — beleértve Staphylococcus és Lactobacillus — izoláltak, és ezek in vitro memória T-sejt-aktivációt indukáltak a magzati mesenteriális nyirokcsomóban. SEM és RNA-ISH baktériumszerű struktúrákat és eubakteriális RNS-t jelenített meg a 14. heti magzati bélürben, alátámasztva szelektív élő mikroba-jelenlétet és a születés előtti immun-priming szerepét. (Az értelmezés vitatott — lásd ref-558 és ref-479.)

[623] Stewart CJ, Ajami NJ, O'Brien JL et al. Temporal development of the gut microbiome in early childhood from the TEDDY study. Nature. 2018. Link

A TEDDY-vizsgálat 903 gyermek (3–46 hónapos kor) longitudinális székletmintái — 12 005 16S rRNS- és 10 867 metagenom-minta — alapján a bélmikrobiom-fejlődés három fázisát definiálták: fejlődési (3–14 hó), átmeneti (15–30 hó) és stabil (31–46 hó). A legjelentősebb tényező a mikrobiom szerkezetében az anyatej (kizárólagos vagy részleges) fogyasztása volt; a szoptatás magasabb Bifidobacterium-fajokkal (B. breve, B. bifidum) társult, a leválasztás Firmicutes-irányba gyorsította a bélmikrobiom érését. Az eredmények jellemzik a mikrobiális-immun kommunikációt, amely sziget-autoimmunitás és 1-es típusú diabétesz kialakulásával kapcsolatos.

[624] von Hertzen L, Hanski I, Haahtela T. Natural immunity. Biodiversity loss and inflammatory diseases are two global megatrends that might be related. EMBO Rep. 2011. Link

Von Hertzen, Hanski és Haahtela 2011-es EMBO Reports-kommentárja ('Natural immunity. Biodiversity loss and inflammatory diseases are two global megatrends that might be related') ökológiai-immunológiai perspektívát szintetizál, amely a csökkenő környezeti biodiverzitást összekapcsolja a gyulladásos és allergiás betegségek növekvő terhével. A szerzők javaslata: a változatos környezeti mikrobákkal való érintkezés csökkenése — urbanizáció, antiszeptikus környezet, feldolgozott élelmiszer és biodiverz tájak elvesztése miatt — gyengíti a korai életkori immuntolerancia-edzést, hozzájárulva az allergiához, asztmához, IBD-hez és autoimmun betegségekhez. A higiéniai/'régi barátok' hipotézist a globális biodiverzitás-vesztés adataihoz kapcsolják. A biodiverzitás-mikrobiom-egészség keret alapreferenciája.

[625] Fitzstevens JL, Smith KC, Hagadorn JI et al. Systematic review of the human milk microbiota. Nutr Clin Pract. 2017. Link

A PubMed (1964. január – 2015. június) szisztematikus áttekintése jellemezte az anyatej mikrobiótáját. Tizenkét vizsgálat felelt meg a beillesztési kritériumoknak (egészséges anyák, angol nyelv, anyatejből származó baktériumok tenyésztéstől független módszerrel, genus-szintű eredményekkel). A vizsgálatok eltértek földrajzi régióban, mintagyűjtésben, tárolásban és elemzési módszerben. Az anyatej-mikrobák korán kolonizálják a csecsemő-bélrendszert, és rövid és hosszú távú egészségügyi kimenetelt befolyásolhatnak; a módszertani heterogenitás korlátozza a vizsgálatok közötti összehasonlítást, és kiemeli a standardizált protokollok szükségességét.

[626] Biagi E, Nylund L, Candela M et al. Through ageing, and beyond: gut microbiota and inflammatory status in seniors and centenarians. PLoS One. 2010. Link

Fiatal felnőttek, idős és centenárius (>100 év) egyének bélmikrobiótáját profilozták HITChippel és 16S rRNS qPCR-rel. A fiatal felnőttek és 70 évesek hasonló mikrobiótát mutattak; a centenáriusok szignifikánsan eltértek. 100 év szimbiózis után a mikrobiótát Firmicutes-átrendeződés és fakultatív anaerob, valamint patobionta-dúsulás jellemezte. A megváltozott mikrobiota „inflammageinggel" — emelkedett perifériás vér gyulladásos markerekkel — társult, amit részben a gyulladáscsökkentő Faecalibacterium prausnitzii és rokonai jelentős csökkenése magyaráz a centenáriusokban.

[628] Rothschild D, Weissbrod O, Barkan E et al. Environment dominates over host genetics in shaping human gut microbiota. Nature. 2018. Link

1046 egészséges, többféle leszármazású egyén genotípus- és mikrobiom-adatai szerint a bélmikrobiom-összetétel nem szignifikánsan társul a genetikai leszármazással, és a gazda-genetikának csak kisebb szerepe van. Ezzel szemben a genetikailag nem rokon, de háztartást megosztó egyének mikrobiomja jelentősen hasonlít egymásra. A személyek közötti mikrobiom-variabilitás több mint 20%-a étrendi, gyógyszer- és antropometriai tényezőkkel korrelál. A mikrobiom-adatok szignifikánsan javították a humán jellegek (glükóz, elhízás-mérőszámok) becslésének pontosságát a csak gazda-genetikát és környezetet tartalmazó modellekhez képest. A mikrobiom-célzott beavatkozások különböző genetikai hátterű populációkra is átvihetők lehetnek.

[629] Kurilshikov A, Medina-Gomez C, Bacigalupe R et al. Large-scale association analyses identify host factors influencing human gut microbiome composition. Nat Genet. 2021. Link

A MiBioGen konzorcium 24 kohorszból származó 18 340 egyén genom-szintű genotípus- és 16S széklet-mikrobióta-adatait elemezte. A mikrobiális összetétel kohorszok között erősen változott (a 410 genus közül csak 9 volt kimutatható a minták >95%-ában). A genom-szintű asszociációs vizsgálat 31 mikrobiom-befolyásoló lókuszt azonosított p<5×10^-8 küszöbnél. Egy lókusz — a laktáz (LCT) gén — vizsgálatszerte szignifikáns volt (p=1,28×10^-20), és életkor-függő összefüggést mutatott a Bifidobacterium abundanciájával. A további szuggesztív asszociációk magas herediátsú taxonokra és bél- és agy-expresszált génekre dúsultak. Mendel-randomizáció szerint a mikrobiom oksági szerepet játszhat colitis ulcerosában és rheumatoid arthritisben.

[630] Cortese R, Lu L, Yu Y et al. Epigenome-Microbiome crosstalk: a potential new paradigm influencing neonatal susceptibility to disease. Epigenetics. 2016. Link

A még fejletlen bél epigenómja és a kezdeti bakteriális kolonizáció közötti keresztkommunikációt vizsgálták kritikus neonatális szakaszokban, ami a koraszülöttek nekrotizáló enterocolitisét (NEC) érinti. Éretlen enterociták probiotikus és patogén baktériumoknak való expozíciója több mint 200 különböző DNS-módosulási régiót eredményezett, expozíció-specifikus mintázattal. Fordítva, prenatális dexamethasone-modellben az antenatális glükokortikoid megváltoztatta a gazda epigenómját. Az eredmények támogatnak egy modellt, amelyben a mikrobák által hajtott epigenetikai programozás megalapozza a neonatális gyulladásos és barrier-tulajdonságokat, NEC-re hajlamosítva.

[631] Asnicar F, Berry SE, Valdes AM et al. Microbiome connections with host metabolism and habitual diet from 1,098 deeply phenotyped individuals. Nat Med. 2021. Link

A PREDICT-1 vizsgálat 1098 résztvevőjének 1203 bélmikrobiomját mély metagenomikai szekvenálással elemezve a kutatók erős összefüggéseket találtak konkrét tápanyagokkal, ételekkel és étrendi indexekkel — kifejezetten egészséges, növényi alapú élelmiszerekkel hajtva. A mikrobiális elhízás-biomarkerek külső kohorszokon is reprodukálódtak, és illeszkedtek a keringő kardiovaszkuláris vérmetabolitokhoz. Egyes mikrobák (Prevotella copri, Blastocystis spp.) kedvező posztprandiális glükózt jeleztek; az összetétel egészben prediktív volt számos kardiometabolikus vér-markerre. Az egészséges étrenddel és kedvező posztprandiális metabolizmussal asszociált mikrobák átfedtek, ami nagyléptékű erőforrást ad a mikrobiom egészség-szintű stratifikálására.

[632] Berry SE, Valdes AM, Drew DA et al. Human postprandial responses to food and potential for precision nutrition. Nat Med. 2020. Link

A PREDICT-1 n=1002 ikerpárt és független brit felnőttet vont be a posztprandiális anyagcsere-válasz klinikai és otthoni értékelésére. Azonos étkezések után jelentős inter-individuális ingadozás volt megfigyelhető a posztprandiális triglicerid (CV 103%), glükóz (68%) és inzulin (59%) válaszokban. A személyspecifikus tényezők — pl. bélmikrobiom — a posztprandiális lipémia varianciájának 7,1%-át adták, szemben az étkezési makrotápanyagok 3,6%-ával; a posztprandiális glikémiánál a makrotápanyagok hozzájárulása nagyobb volt (15,4% vs 6,0% mikrobiom). A genetikai variánsok hatása mérsékelt volt (glükóz 9,5%, triglicerid 0,8%, C-peptid 0,2%). Egy USA-kohorsz (n=100) függetlenül validálta az eredményt; egy gépi tanulási modell jósolta a triglicerid- (r=0,47) és glikémiás (r=0,77) választ az ételre.

[634] Schmitt FCF, Brenner T, Uhle F et al. Gut microbiome patterns correlate with higher postoperative complication rates after pancreatic surgery. BMC Microbiol. 2019. Link

Prospektív klinikai pilot vizsgálatban 32 pancreas-műtéten átesett betegnél 116 székletmintát elemeztek 16S rRNS-szekvenálással. Betegenként egy preoperatív (műtéti stressz és antibiotikum nélküli) alapminta, valamint legalább két posztoperatív minta a műtét utáni 10 napon belül készült; szövődmény esetén további mintákat is vettek. A vizsgálat célja a bélmikrobiom-változás jellemzése pancreas-műtét után, és összefüggéseinek feltárása a posztoperatív lefolyással — beleértve a barrier-diszfunkciót és bakteriális transzlokációt — a posztoperatív szövődmények mikrobiom-szerepének felmérésére.

[636] Barton W, Penney NC, Cronin O et al. The microbiome of professional athletes differs from that of more sedentary subjects in composition and particularly at the functional metabolic level. Gut. 2018. Link

Metabolikus fenotipizálás és funkcionális metagenomikai elemzés hasonlított össze 40 professzionális nemzetközi rögbi-játékost és 46 kontrollt, összefüggésbe hozva az eredményeket az életmóddal (pl. étrend) és klinikai mérésekkel (pl. szérum-kreatinkináz). A sportolóknál relatíve nőttek a metagenomikai útvonalak (aminosav- és antibiotikum-bioszintézis, szénhidrát-anyagcsere) és a fecal-metabolitok (acetát, propionát, butirát), amelyek fokozott izom-megújulással és egészséggel asszociáltak. A sportolók és ülő kontrollok közötti különbségek nagyobbak voltak a metagenomikai és metabolomikai szinten, mint az összetételi szinten — további betekintést nyújtva a diéta-testmozgás-bélmikrobiota paradigmába.

[638] Chaix A, Manoogian ENC, Melkani GC, Panda S. Time-Restricted Eating to Prevent and Manage Chronic Metabolic Diseases. Annu Rev Nutr. 2019. Link

A szervezet szinte minden sejtjében molekuláris óra működik, amely a napi, kiszámítható változásokra (pl. a tápanyag ritmikus elérhetőségére) készül fel, míg a tápanyag-érzékelő útvonalak az akut egyensúlyhiányra reagálnak; a cirkadián ritmusokat viselkedési ciklusok (aktivitás-pihenés, étkezés-böjt) hangolják össze. A cirkadián biológia és a táplálkozástudomány integrálásából született az időkorlátos étkezés (TRE), amelyben a napi kalóriabevitelt állandó, 8–12 órás ablakra korlátozzák. Ez az áttekintés a TRE szerepét tárgyalja a krónikus metabolikus betegségek megelőzésében és kezelésében.

[640] Park BJ, Tsunetsugu Y, Kasetani T et al. The physiological effects of Shinrin-yoku (taking in the forest atmosphere or forest bathing): evidence from field experiments in 24 forests across Japan. Environ Health Prev Med. 2010. Link

Park és munkatársai a Shinrin-yoku (az erdő légkörének „belélegzése”, erdőfürdőzés) élettani hatásait tekintik át, és Japán 24 erdejében végzett terepkísérletek eredményeit közlik (összesen 280 fiatal résztvevő, keresztezett erdei vs. városi sétával). Az erdei környezet a városihoz képest alacsonyabb kortizolszintet, pulzust és vérnyomást, csökkent szimpatikus és fokozott paraszimpatikus aktivitást eredményezett — vagyis mérhető élettani relaxációt.

[2614] Chassaing B, Compher C, Bonhomme B et al. Randomized Controlled-Feeding Study of Dietary Emulsifier Carboxymethylcellulose Reveals Detrimental Impacts on the Gut Microbiota and Metabolome. Gastroenterology. 2022. Link

16 fős, kontrollált betáplálási RCT humán önkénteseken. A karboximetil-cellulóz (CMC, E466) emulgeálószert tartalmazó étrend 11 napon belül megváltoztatta a bélmikrobiota összetételét, csökkentette a mikrobiális diverzitást és a fermentációs metabolitok szintjét, illetve két résztvevőnél bakteriális mucus-réteg invázió jelei mutatkoztak. Először igazolt humán bizonyíték arra, hogy a CMC az engedélyezett napi expozíció mellett is káros mikrobiológiai hatásokkal jár.

[2615] Sutton EF, Beyl R, Early KS et al. Early Time-Restricted Feeding Improves Insulin Sensitivity, Blood Pressure, and Oxidative Stress Even without Weight Loss in Men with Prediabetes. Cell Metabolism. 2018. Link

Cross-over RCT 8 férfi prediabéteszessel: az étkezések 6-órás reggeli ablakra (eTRF, 8:00–14:00) szorítása 5 héten át — energiabevitel-egyezés mellett — szignifikánsan javította az inzulinérzékenységet, a β-sejt-választ, a vérnyomást és az oxidatív stresszt a kontroll 12-órás ablakhoz képest. Súlyveszteség NEM volt szükséges a kedvező metabolikus változásokhoz, vagyis a hatás a cirkadián szinkronizációból ered.

[2616] Wilkinson MJ, Manoogian ENC, Zadourian A et al. Ten-Hour Time-Restricted Eating Reduces Weight, Blood Pressure, and Atherogenic Lipids in Patients with Metabolic Syndrome. Cell Metabolism. 2020. Link

12 hetes egykarú vizsgálat 19 metabolikus szindrómás betegen: napi 10-órás étkezési ablak (TRE) — egyéb étrendi vagy aktivitási változás nélkül — szignifikánsan csökkentette a testtömeget, derékkörfogatot, vérnyomást, LDL-koleszterint és a HbA1c-t. A javulások mértéke klinikailag jelentős, a beavatkozás jól tolerált és önként folytatott a vizsgálat után. Megerősíti, hogy a TRE biztonságos és hatékony adjuvánsa a metabolikus szindróma kezelésének.

[2617] {EFSA Panel on Dietetic Products Nutrition,, Allergies (NDA). Scientific Opinion on Dietary Reference Values for carbohydrates and dietary fibre. EFSA Journal. 2010. Link

Az Európai Élelmiszerbiztonsági Hatóság (EFSA) NDA-paneljének tudományos véleménye a szénhidrát- és élelmi-rost referenciaértékekről. A felnőtt populációra napi 25 g rost-bevitelt javasol megfelelő bélműködéshez, valamint 25–30 g/nap tartományt a metabolikus és kardiovaszkuláris kockázat csökkentéséhez. Európai referenciaérték a többi nemzeti irányelv (DGE, NHS, MDOSZ) alapjául szolgál.

[2618] Sarkadi Nagy E, Bakacs M, Illés É et al. Hungarian Diet and Nutritional Status Survey — the OTÁP2014 study. II. Energy and macronutrient intake of the Hungarian population. Orvosi Hetilap. 2017. Link

Az Országos Táplálkozás- és Tápláltsági Állapot Vizsgálat (OTÁP2014) reprezentatív magyar felnőtt mintán mérte az energia- és makrotápanyag-bevitelt. A medián rost-bevitel férfiaknál 19,8 g/nap, nőknél 17,2 g/nap volt — érdemben elmarad az EFSA 25 g/nap referenciaértékétől. Az utolsó nagyszabású magyar reprezentatív táplálkozási felmérés, az MDOSZ és az NNK ajánlások alapja.

[2620] Alderete TL, Jones RB, Chen Z et al. Exposure to traffic-related air pollution and the composition of the gut microbiota in overweight and obese adolescents. Environmental Research. 2018. Link

43 túlsúlyos és elhízott latin-amerikai serdülőből álló kohorszban a légszennyezés (PM2.5 és NO₂) bélmikrobiota-összetételhez való kapcsolatát vizsgálták. A magas légszennyezésű környékeken élő résztvevőknél csökkent mikrobiális diverzitás és az Coriobacteriaceae család emelkedett dominanciája volt megfigyelhető, ami az inzulinrezisztenciával is összefüggést mutatott. Az első humán vizsgálatok egyike, amely a környezeti levegő-PM-szintek és a gut microbiota közötti kapcsolatot dokumentálja.

[2713] Marshall BJ, Warren JR. Unidentified curved bacilli in the stomach of patients with gastritis and peptic ulceration. The Lancet. 1984. Link

Marshall és Warren 1984-es Lancet-közleménye azonosította a később Helicobacter pylori néven ismert görbe baktériumot a gyomorhurutban és gyomor-/nyombélfekélyben szenvedő betegek gyomornyálkahártyáján. A felfedezést Marshall egy híres önkísérlettel is alátámasztotta. Átírta a fekélybetegség kórtanát: a korábbi „stressz és sav" paradigmát felváltotta a fertőzéses modell, megnyitva az utat az antibiotikumos eradikációs kezelés előtt. A munka 2005-ben orvosi Nobel-díjat kapott.

[2714] Alang N, Kelly CR. Weight Gain After Fecal Microbiota Transplantation. Open Forum Infectious Diseases. 2015. Link

Esetjelentés egy visszatérő Clostridioides difficile fertőzés miatt FMT-vel sikeresen kezelt, korábban normál testsúlyú nőről, aki a túlsúlyos (rokon) donortól kapott székletszuszpenzió után 16 hónap alatt elhízott (BMI 26→33). Az eset felvetette, hogy a donor metabolikus fenotípusa részben átvihető a recipiensre a mikrobiotán keresztül. Egyetlen eset nem oksági bizonyíték (egyéb tényezők is szerepet játszhattak), de a közlemény a donor-kiválasztás és -szűrés jelentőségét hangsúlyozza.

[2715] Eng J, Kleinman WA, Singh L, Singh G, Raufman JP. Isolation and characterization of exendin-4, an exendin-3 analogue, from Heloderma suspectum venom. Journal of Biological Chemistry. 1992. Link

Eng és munkatársai a Gila-szörny (Heloderma suspectum) mérgéből izolálták az exendin-4 nevű peptidet, amely szerkezetileg hasonló a humán GLP-1 inkretinhormonhoz, de ellenáll a DPP-4 enzim általi gyors lebontásnak, ezért lényegesen hosszabb ideig hat. Ez a véletlen eredetű felfedezés lett a GLP-1 receptor agonista gyógyszercsalád alapja: az exendin-4 szintetikus változata (exenatid) 2005-ben lett az első engedlyezett GLP-1-agonista, megnyitva az utat a mai szemaglutid és tirzepatid előtt.

[2716] Wilding JPH, Batterham RL, Calanna S, et al. Once-Weekly Semaglutide in Adults with Overweight or Obesity (STEP 1). New England Journal of Medicine. 2021. Link

A STEP 1 fázis-3, randomizált, placebo-kontrollált vizsgálat (n=1961, túlsúlyos/elhízott, nem cukorbeteg felnőttek) heti egyszeri 2,4 mg szubkután szemaglutidot hasonlított össze placebval, életmód-tanácsadás mellett, 68 héten át. A szemaglutid-csoport átlagosan ~14,9%-os testsúlycsökkenést ért el a placebo ~2,4%-ával szemben. A leggyakoribb mellékhatások gastrointestinalisak (hányinger, hasmenés) voltak, többségükben átmenetiek.

[2717] (experimental study, high-fat diet-induced obese mice). Effects of semaglutide on metabolism and gut microbiota in high-fat diet-induced obese mice. Frontiers in Pharmacology. 2025. Link

Állatkísérletes (magas zsírtartalmú étrenddel hizlalt egér) vizsgálat, amely szerint a szemaglutid kedvezően módosítja a szérum-anyagcserét és a bélmikrobiota összetételét, és a metabolikus javulás részben átvihető széklettranszplantációval. FONTOS: ez preklinikai, állatkísérletes bizonyíték; a humán relevancia egyelőre nem igazolt, ezért az állítást hipotézisként () kell kezelni.

[2718] Tomás-Barberán FA, García-Villalba R, González-Sarrías A, Selma MV, Espín JC. Urolithin metabotypes from ellagitannin-rich foods and association with cardiometabolic risk. Molecular Nutrition & Food Research. 2017. Link

A gránátalma és dió ellagitanninjaiból a bélmikrobiota urolitineket termel; az egyének három metabotípusba sorolhatók aszerint, milyen urolitineket képesek előállítani (UM-A, UM-B és a nem-termelő UM-0). A termelő-profilt a mikrobiota összetétele határozza meg, és összefügg a kardiometabolikus kockázati markerekkel — vagyis ugyanaz az élelmiszer egyénenként eltérő egészséghatást fejthet ki. A „mikrobiális melléktermék" (posztbiotikum) és a személyre szabott táplálkozás kulcspéldája.

[2719] Setchell KDR, Clerici C. Equol: history, chemistry, and formation. The Journal of Nutrition. 2010. Link

Áttekintő közlemény az equolról, a szója daidzein izoflavonjából bélbaktériumok által képzett metabolitról. A népességnek csak mintegy 25–30%-a „equol-termelő" — azaz rendelkezik a megfelelő bélbaktériumokkal —, ami magyarázhatja, miért ellentmondásosak a szója egészséghatásait vizsgáló eredmények. Az equol-termelő státusz a mikrobiota-összetételtől függő metabotípus, a személyre szabott táplálkozás korai, jól dokumentált példája.

[2720] Zeevi D, Korem T, Zmora N, et al. Personalized Nutrition by Prediction of Glycemic Responses. Cell. 2015. Link

800 fős kohorszban közel 47 000 étkezés utáni vércukor-választ mértek folyamatos glükózmonitorral. Ugyanarra az ételre az egyének vércukor-válasza jelentősen eltért, és ezt részben a bélmikrobiota összetétele jelezte előre. A szerzők gépi tanuláson alapuló, személyre szabott modellt építettek, amely jobban előrejelezte az egyéni választ, mint a pusztn tápanyag-alapú számítás; egy rövid, személyre szabott étrendi beavatkozás csökkentette a vércukor-ingadozást. A „nincs egy méret mindenkinek" táplálkozás-paradigma alapköve.

E.2 Továbbolvasás laikus olvasóknak

A következő olvasmány-ajánlások azoknak szólnak, akik a könyv által felvázolt képet kontextusban szeretnék elhelyezni — nem szakcikkek, hanem narratív és népszerűsítő művek. A válogatás szempontja a tudományos megbízhatóság: a listán nem szerepel olyan kötet, amely a marketing-szintű ígéreteket a klinikai evidencia helyére helyezi. Magyar és angol nyelvű címek vegyesen, könnyen elérhető verziókkal.

Magyar népszerű-tudományos könyvek

• (jövőbeli kiegészítés a v2.1-ben)

Nemzetközi népszerű-tudományos könyvek

• Spector T. The Diet Myth. 2015 — még mindig az egyik legjobb laikus áttekintés
• Knight R. Follow Your Gut. 2015 (TED Books)
• Sonnenburg J, Sonnenburg E. The Good Gut. 2015
• Enders G. Gut: The Inside Story of Our Body's Most Underrated Organ. 2015

Hiteles weboldalak

• ISAPP (International Scientific Association for Probiotics and Prebiotics): isappscience.org
• American Gut Project: humanfoodproject.com/americangut
• WGO (World Gastroenterology Organisation) Global Guidelines: worldgastroenterology.org

Podcastok

• Stanford Center for Continuing Medical Education podcasts
• American Gastroenterological Association podcasts

E.3 Továbbolvasás klinikusoknak

Klinikai olvasóknak szóló ajánlások: szisztematikus áttekintések, klinikai irányelvek és szakmai konszenzus-dokumentumok, amelyek a mikrobiom-medicínát szakmailag releváns mélységben mutatják be. A válogatás 2022–2025 közötti publikációkra koncentrál (kivéve a már klasszikus mérföldkő-anyagokat). PubMed/DOI-elérhetőséggel.

Friss szisztematikus reviews

• Nat Rev Gastroenterol Hepatol évenkénti microbiome-overview-i
• Lancet Gastroenterology & Hepatology

Kulcsfontosságú folyóiratok

• Gut (BMJ)
• Gastroenterology (AGA)
• Cell Host & Microbe
• Microbiome (BMC)
• Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology

Konferenciák és társaságok

• ISAPP éves találkozók
• DDW (Digestive Disease Week)
• UEG Week (United European Gastroenterology Week)
• Magyar Gasztroenterológiai Társaság
• Magyar Mikrobiom Konzorcium (kialakulóban)

Konszenzus-dokumentumok keretrendszerként

• ISAPP probiotikum-, prebiotikum-, posztbiotikum-konszenzusok ([@ref-561, @ref-563, @ref-564])
• ESCMID, ECCO IBD guidelines
• Rome IV criteria for functional bowel disorders