5. lépés: Megjegyzés a részleges válaszról
A részleges válasz valódi, értékes eredmény: az FMT nem be-ki kapcsoló gyógyszer, hanem ökológiai beavatkozás, ahol a kisebb javulás is sokat számít.
A részleges válasz — érdemleges javulás teljes klinikai remisszió nélkül — érvényes és klinikailag jelentős eredmény. Az FMT legpontosabban valószínűségalapú kimenetelű ökológiai beavatkozásként értelmezhető, nem bináris (be/ki) hatású gyógyszerként. A részleges választ elérő betegek gyakóran jelentős életminőség-javulásról számolnak be, még a formális remissziós kritériumok teljesülése nélkül is. A részleges választ nem szabad kezelési kudarcként kommunikálni a beteg felé, és az újrakezelési döntést a beteg értékeinek, tüneti terhének és az adott indikációra reálisan várható eredményeknek kell vezérelni.
A fenti non-responder-keret célja annak biztosítása, hogy minden látszólagos non-response szisztematikusan kivizsgálásra kerüljön, mielőtt azt a következtetést vonnák le, hogy az FMT az adott beteg számára nem műkkodik. A leggyakoribb visszafordítható okok — antibiotikum-expozíció, étrendregressió és exposome-szabotázs — egyben a leggyakórabban figyelmen kívül hagyottak is.