II. Phase 1 – La cure aiguë et les fondations (jours 4–24)

II. 3. Pourquoi revient-elle ? La CDI récidivante

Si ce n'est pas la première fois que vous vous battez contre C. difficile, ce n'est pas de votre faute. Vous comprenez pourquoi l'infection revient avec autant d'obstination, et pourquoi c'est précisément la restauration de la flore qui brise cette spirale.

Résumé

L'un des traits les plus difficiles à supporter de l'infection à C. difficile[G] est sa tendance à revenir. Dès le premier épisode, elle récidive[G] chez un patient sur trois ou quatre, et plus elle revient souvent, plus le risque d'une nouvelle rechute augmente – après plusieurs récidives, il dépasse déjà 60 pour cent. Ce n'est pas votre échec : il s'agit d'un cercle vicieux auto-entretenu, provoqué par le fait que la flore endommagée ne se reconstruit pas suffisamment. Dans ce chapitre, vous comprenez pourquoi cette spirale se met en place, et pourquoi c'est précisément la restauration de la flore qui la brise.

Les chiffres derrière lesquels vous vous tenez, vous aussi

De nombreux patients croient qu'une fois « tirés d'affaire », c'est terminé. La réalité est que l'infection à C. difficile revient souvent. Après le premier épisode, l'infection se réveille chez environ 20 à 30 pour cent des patients. C'est déjà un taux élevé en soi – mais la situation est encore plus parlante lorsqu'une personne a rechuté plus d'une fois.

C'est que chaque rechute augmente encore le risque de la suivante. Chez une personne chez qui l'infection a déjà récidivé plusieurs fois, la probabilité de la récidive suivante peut dépasser 60 pour cent. Ce n'est donc pas un hasard si vous avez le sentiment que cela devient de plus en plus difficile : l'infection tombe dans un schéma qui s'auto-alimente, et après chaque cycle elle revient toujours plus facilement.

Ainsi, si vous en êtes vous aussi à votre énième épisode, cela ne signifie pas que vous avez fait quelque chose de travers, ni que vous êtes « plus faible ». Le retour tient à la nature de la maladie – et c'est précisément cette nature que vise la cure DiffBiome, en s'attaquant non seulement au pathogène, mais aussi au problème sous-jacent qui alimente le retour.

Le cercle vicieux – pourquoi cela devient-il une spirale ?

Le mécanisme de la récidive est logique si l'on y réfléchit étape par étape. Le traitement initial typique de l'infection à C. difficile est un antibiotique, qui fait effectivement reculer le pathogène – les troubles s'apaisent temporairement. Le piège est que ce même antibiotique raréfie encore la flore protectrice, si bien que la résistance à la colonisation[G] – le bouclier naturel évoqué au chapitre précédent – ne peut pas se rétablir.

Pendant ce temps, les spores[G] résistantes de C. difficile survivent dans l'intestin. Dès la fin de la cure d'antibiotiques, alors que la flore est encore faible et raréfiée, les spores survivantes germent, la bactérie se multiplie de nouveau et les troubles reviennent. Un autre antibiotique suit – qui, une fois de plus, affaiblit davantage la flore. Voilà le cercle vicieux : après chaque cycle, la protection est plus faible, le retour plus facile et les symptômes plus sévères.

La solution ne peut donc pas consister à tenter de vaincre le pathogène avec des antibiotiques toujours plus puissants – cela ne fait qu'aggraver le problème. La spirale peut être brisée là où elle naît : à la reconstruction de la flore[G]. Si la flore intestinale diversifiée et protectrice est restaurée, la résistance à la colonisation revient, les spores survivantes ne peuvent plus germer, et le cycle est rompu. C'est exactement l'objectif de la FMT[G] DiffBiome.

Ce qui peut arriver, et ce qui n'est pas de votre faute

De nombreux patients vivent des mois ou des années avec une diarrhée qui revient sans cesse, dans l'incertitude constante du « moment où surviendra la prochaine attaque ». C'est épuisant, et cela laisse souvent des traces sur l'humeur, le travail et la vie sociale. Il faut le dire clairement : ce fardeau n'est pas de votre faute, et il ne vient pas de ce que vous n'auriez « pas été assez prudent ».

La bonne nouvelle est que c'est précisément dans les cas récidivants que le bénéfice de la restauration de la flore est le plus frappant. Plus vous avez traversé de rechutes, plus le risque est grand que le recours à l'antibiotique ciblant le pathogène ne fasse qu'aggraver la situation – et plus il est important de ne pas simplement supprimer les symptômes, mais de traiter la racine du retour. Dans votre journal, au cours des semaines à venir, vous pourrez constater par vous-même comment la tendance de vos symptômes s'oriente régulièrement dans la bonne direction.

🩺 Bloc clinique

La CDI récidivante (rCDI) est définie par le retour des symptômes, typiquement dans les 8 semaines suivant la fin du traitement (McDonald LC 2018 [023]). Le taux de récidive après le premier épisode est d’environ 20–30 % (environ 25 % selon la recommandation de l’ACG), et le risque s’élève de façon cumulative à chaque nouvel épisode : jusqu’à 45 % après un deuxième épisode et, seulement après trois épisodes ou plus, il peut dépasser 60 % (Kelly 2021 [005]). Le moteur de la spirale est la dysbiose[G] persistante et la population sporale persistante – une exposition antibiotique répétée entretient l'absence de résistance à la colonisation (Chilton 2018 [007]). C’est pourquoi, en cas de récidives multiples, l’objectif thérapeutique s’oriente vers la restauration de la flore. Les paliers antibiotiques : 1er épisode fidaxomicine 200 mg 2×/jour p.o. pendant 10 jours (préférée) ou vancomycine 125 mg 4×/jour p.o. pendant 10 jours ; 1re récidive fidaxomicine en schéma standard ou en schéma pulsé prolongé (extended-pulsed), et en alternative vancomycine en schéma dégressif/pulsé (tapered/pulsed) ou standard ; le bezlotoxumab n’est pas une alternative à part entière, mais un complément administré en plus de l’antibiothérapie standard (IDSA/SHEA 2021 [028] ; ESCMID 2021 [017]). En cas de ≥2 récidives (rCDI multiple), la FMT est le traitement recommandé : la recommandation thérapeutique ESCMID 2021 la désigne comme l’option privilégiée dès la deuxième récidive ou au-delà (van Prehn 2021 [017]), en cohérence avec la mise à jour ciblée IDSA/SHEA 2021 (Johnson 2021 [028]) et avec le consensus européen sur la FMT (Cammarota 2017 [016]). Dans le premier essai randomisé (van Nood 2013 [029], NEJM ; n=43, monocentrique, interrompu précocement), la perfusion duodénale de selles de donneur a guéri 81 % des patients après la première administration et 94 % au total avec une administration répétée, contre 31 % pour la vancomycine seule (vancomycine plus lavage intestinal : 23 %). Dans la littérature randomisée plus large, le taux de guérison agrégé d’une FMT unique est plus faible, environ 76 %, et l’estimation restreinte aux essais randomisés (67,7 %) reste inférieure à celle des études ouvertes (82,7 %) (BSG/HIS 2024 [777]). Dans l'infection à C. difficile récidivante, réfractaire ou résistante au traitement, la FMT est recommandée par les recommandations cliniques internationales, et la réglementation nationale la permet sur cette base : comme médicament aux États-Unis et, dans l'Union européenne, dans le cadre des substances d'origine humaine (SoHO[G]) (Hoffmann 2025 [024]; Rodriguez 2025 [025]). L'avenir s'oriente vers le traitement des cas primaires par FMT.

Jour 10 – Revenez sur votre histoire

Aujourd'hui, vous cartographiez votre propre parcours : combien de fois et quand l'infection est-elle revenue jusqu'ici ? Cela vous aide, vous et votre médecin, à voir le schéma. Pendant ce temps, vous poursuivez la cure.

  • Prise de la dose quotidienne de DiffBiome selon la routine habituelle ;
  • Notez combien de fois et approximativement quand votre infection a récidivé jusqu'ici ;
  • Réhydratation : un verre supplémentaire après chaque selle plus molle ;
  • Journal : nombre de selles, Bristol, ballonnements, selles sanglantes, liquides, bien-être.
Jour 11 – Briser la spirale

Aujourd'hui, prenez conscience que vous faites désormais quelque chose de différent d'avant : vous ne cherchez pas à supprimer les symptômes avec un antibiotique de plus, vous reconstruisez la flore. C'est là toute la différence.

  • Prise de la dose quotidienne de DiffBiome ;
  • Ne commencez de votre propre initiative aucune cure d'antibiotiques ou de probiotiques ;
  • Reposez-vous suffisamment – la régénération fait partie du rétablissement ;
  • Journal : nombre de selles, Bristol, ballonnements, liquides, bien-être.
Jour 12 – Faites confiance au processus

Aujourd'hui est un jour de patience : la reconstruction de la flore prend du temps, mais la tendance de vos symptômes peut déjà montrer une amélioration. Voyez dans quelle direction elle va.

  • Prise de la dose quotidienne de DiffBiome ;
  • Journal : revue de la tendance du nombre de selles et de Bristol pour les jours 10–12 ;
  • Si le nombre de selles ne diminue pas, alertez votre médecin traitant (un nombre de gélules plus élevé peut être nécessaire) ;
  • En cas de signal d'alerte → consultez immédiatement un médecin.

🍽️ L'alimentation pendant ces jours

Pendant ces trois jours, vous comprenez pourquoi l'infection revient avec autant d'obstination, et pourquoi c'est la restauration de la flore qui brise la spirale des récidives – et votre alimentation soutient maintenant l'apaisement de votre intestin pendant que cette flore se reconstruit. Comme le danger de diarrhée et de déshydratation demeure, l'objectif est une alimentation douce et constipante : beaucoup de liquides, des aliments faciles à digérer et des fibres solubles. Les fibres solubles forment un gel dans l'eau, ce qui ralentit le passage du contenu intestinal et favorise des selles plus fermes, tandis qu'une abondance de liquides remplace la quantité perdue avec des selles plus molles. Vos tâches concrètes : pendant les trois jours, prenez la dose quotidienne selon la routine habituelle, buvez un verre d'eau supplémentaire après chaque selle plus molle, et ne commencez pas de votre propre initiative une nouvelle cure d'antibiotiques ou de probiotiques qui perturberait de nouveau la flore en cours de reconstruction.

Dans cette phase précoce, il n'y a pas encore de plante quotidienne – le Calendrier des plantes ne commence qu'au jour 15. Pour l'instant, restez sur des aliments faciles à digérer, bouillis ou cuits à la vapeur, et évitez les aliments crus, grossiers et fortement fermentescibles ; la construction d'une alimentation variée et diversifiée viendra plus tard, à mesure que les symptômes s'apaisent.

📊 Données

Pendant ces jours, consignez chaque jour :

  • dose de DiffBiome (gélules/jour) et numéro de LOT ;
  • nombre quotidien de selles ;
  • échelle de Bristol des selles (1–7) ;
  • ballonnements (0–5) ;
  • selles sanglantes (oui/non) ;
  • apport hydrique (litres) ;
  • bien-être (1–5) ;
  • note : le nombre et la date des rechutes antérieures ;
  • Mouvement : type + minutes, nombre de pas (objectif/réel) ;
  • Niveau de stress (1–5) et humeur (1–5) ;
  • Sommeil (heures + qualité 1–5).

Pourquoi est-ce important ?

Si vous comprenez que le retour est une spirale auto-entretenue alimentée par la flore endommagée, vous comprenez aussi pourquoi la solution ne réside pas dans des attaques sans cesse renouvelées contre le pathogène. La cure DiffBiome vise la racine du cycle : en restaurant la flore, elle redonne la résistance à la colonisation, et brise ainsi la chaîne des rechutes.

Références

[005] Kelly C, Fischer M, Allegretti J, LaPlante K, Stewart D, Limketkai B, Stollman N. ACG Clinical Guidelines: Prevention, Diagnosis, and Treatment of Clostridioides difficile Infections. The American journal of gastroenterology. 2021. Link

Selon la recommandation ACG 2021, la FMT fait partie de la prise en charge standard de la rCDI ; elle est fortement recommandée après ≥2 récidives — Dernières recommandations sur la CDI de l'American College of Gastroenterology : FMT fortement recommandée après ≥2 récidives de CDI ; les administrations par capsules et par coloscopie sont équivalentes ; protocole détaillé de dépistage des donneurs et de stockage ; mises à jour de l'ère COVID concernant la sécurité de la FMT également intégrées.

[007] Chilton C, Pickering D, Freeman J. Microbiologic factors affecting Clostridium. difficile recurrence. Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. 2018. Link

Causes microbiologiques de la récidive de C. difficile — persistance des spores et dysbiose — Une faible diversité bactérienne est corrélée à la rCDI clinique. La persistance des spores et leur germination sont la clé de la récidive. La FMT et les thérapies du microbiote sont de plus en plus étudiées. Antibiotiques ciblés (fidaxomicine) + restauration du microbiote constituent l'approche combinée.

[016] Cammarota G, Ianiro G, Tilg H et al. European consensus conference on faecal microbiota transplantation in clinical practice. Gut. 2017. Link

Conférence de consensus européenne élaborant des recommandations fondées sur les preuves relatives à la FMT en pratique clinique, avec 28 experts de 10 pays collaborant au sein de groupes de travail. Les énoncés ont été produits par une revue fondée sur les preuves, évalués électroniquement par un processus Delphi, puis finalisés lors d'une séance plénière de consensus. Les recommandations portent sur les indications de la FMT, la sélection des donneurs, la préparation du matériel fécal, la prise en charge clinique, l'administration des selles et les exigences minimales pour créer un centre de FMT. Le document fournit le cadre européen de standardisation d'une FMT sûre et encadrée.

[017] van Prehn J, Reigadas E, Vogelzang EH, Bouza E, Kuijper EJ et al. European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases: 2021 update on the treatment guidance document for Clostridioides difficile infection in adults. Clinical Microbiology and Infection. 2021. Link

Document d'orientation thérapeutique de l'ESCMID 2021 pour l'infection à C. difficile chez l'adulte. Le métronidazole n'est plus recommandé lorsque la fidaxomicine ou la vancomycine sont disponibles ; la fidaxomicine est l'agent préféré pour l'épisode initial et la première récidive ; à partir de la deuxième récidive, la transplantation de microbiote fécal (FMT) ou le bezlotoxumab en complément du traitement antibiotique standard sont préférés. Par rapport à l'édition précédente, l'accent passe de la sévérité de la maladie au risque de récidive : la stratégie thérapeutique est déterminée par le risque individuel de rechute. Cela conforte une évaluation qui mesure à la fois les symptômes actuels et le risque pronostique.

[023] McDonald LC, Gerding DN, Johnson S, Bakken JS, Carroll KC et al. Clinical Practice Guidelines for Clostridium. difficile Infection in Adults and Children: 2017 Update by the Infectious Diseases Society of America (IDSA) and Society for Healthcare Epidemiology of America (SHEA). Clinical Infectious Diseases. 2018. Link

Recommandations de pratique clinique complètes de l'IDSA et de la SHEA sur le diagnostic, le traitement et la prévention de l'infection à C. difficile chez l'adulte et l'enfant. Elles définissent des catégories de gravité (non sévère, sévère, fulminante) et caractérisent la forme fulminante par une hypotension ou un choc, un iléus ou un mégacôlon toxique — des signes qui imposent une hospitalisation, un traitement intraveineux et un avis chirurgical. En cas d'infection à récidives multiples avec échecs répétés de l'antibiothérapie, la transplantation de microbiote fécal est recommandée. Ce document constitue le cadre international auquel s'alignent les signaux d'alerte et les critères d'orientation hospitalière du livre.

[024] Hoffmann DE, Javitt GH, Kelly CR, Keller JJ, Baunwall SMD, Hvas CL. Fecal microbiota transplantation: a tale of two regulatory pathways. Gut Microbes. 2025. Link

Analyse conjointe de juristes et de cliniciens sur la manière dont la transplantation de microbiote fécal s'est retrouvée sur deux voies réglementaires divergentes. Aux États-Unis, elle est traitée comme un médicament (nouveau médicament expérimental ou produit autorisé) ; en Europe, elle relève du cadre des substances d'origine humaine (SoHO). Les auteurs examinent ce que cela implique pour la sélection des donneurs, la traçabilité, l'accès et la responsabilité. Point commun aux deux voies : la FMT n'est pas un produit librement accessible mais une procédure soumise à une supervision médicale et à un cadre institutionnel contrôlé — quelle que soit la voie juridique suivie par le pays concerné.

[025] Rodriguez J, Cordaillat-Simmons M, Pot B, Druart C. The regulatory framework for microbiome-based therapies: insights into European regulatory developments. npj Biofilms and Microbiomes. 2025. Link

Revue du cadre réglementaire européen des thérapies fondées sur le microbiote. L'article distingue les produits biothérapeutiques vivants (LBP), qui peuvent être autorisés comme médicaments, des substances issues de donneurs, qui relèvent du cadre européen des substances d'origine humaine (SoHO) — dont la transplantation de microbiote fécal. Il souligne que la sélection des donneurs, la traçabilité et la supervision clinique constituent des exigences minimales, et que la pratique des États membres peut varier au sein du cadre commun. C'est l'arrière-plan international auquel se conforme la formulation du livre « liée à une surveillance médicale et à un cadre institutionnel ».

[028] Johnson S, Lavergne V, Skinner AM, Gonzales-Luna AJ, Garey KW, Kelly CP, Wilcox MH. Clinical Practice Guideline by the Infectious Diseases Society of America (IDSA) and Society for Healthcare Epidemiology of America (SHEA): 2021 Focused Update Guidelines on Management of Clostridioides difficile Infection in Adults. Clinical Infectious Diseases. 2021. Link

Une mise a jour ciblee de la recommandation IDSA/SHEA de 2017, limitee aux propositions therapeutiques. Le changement principal est que la fidaxomicine est desormais preferee a la vancomycine pour un premier episode — recommandation conditionnelle, certitude moderee —, car si la guerison initiale est comparable, la guerison durable est meilleure. Pour les episodes recidivants, la fidaxomicine est egalement preferee, de meme qu'un schema de vancomycine en decroissance et en pulses. Le bezlotoxumab est propose en complement chez les patients a haut risque de recidive. Le texte precise que la vancomycine reste un choix acceptable lorsque la fidaxomicine n'est pas disponible, et le metronidazole a recule meme dans les formes legeres. Pour le SIS, cette recommandation compte parce qu'elle confirme que la decision therapeutique ne depend pas seulement de la gravite actuelle mais aussi du risque de recidive — la dualite qui fonde les sous-scores aigu et pronostique du SIS.

[029] van Nood E, Vrieze A, Nieuwdorp M, Fuentes S, Zoetendal EG, de Vos WM, Visser CE, Kuijper EJ, Bartelsman JF, Tijssen JG, Speelman P, Dijkgraaf MG, Keller JJ. Duodenal infusion of donor feces for recurrent Clostridium. difficile. The New England Journal of Medicine. 2013. Link

Le premier essai randomise controle comparant la transplantation de microbiote fecal au traitement antibiotique standard dans l'infection recidivante a *Clostridioides difficile*. Les patients ont ete repartis en trois bras : selles de donneur administrees par sonde duodenale apres une courte cure de vancomycine, vancomycine seule, ou vancomycine avec lavage intestinal. L'essai a ete interrompu de facon anticipee tant la difference etait importante : dans le bras transplantation, 81 pour cent des patients etaient gueris apres la premiere infusion et 94 pour cent en comptant les infusions repetees, contre 31 et 23 pour cent dans les deux bras vancomycine. Apres le traitement, la diversite de la flore fecale des patients s'est rapprochee de celle des donneurs. Ce travail a fait de la transplantation de microbiote un traitement fonde sur les preuves et constitue le point de depart du schema posologique du present protocole.

[777] Mullish BH, Merrick B, Quraishi MN et al. The use of faecal microbiota transplant as treatment for recurrent or refractory Clostridioides difficile infection and other potential indications: second edition of joint British Society of Gastroenterology (BSG) and Healthcare Infection Society (HIS) guidelines. Gut. 2024. Link

Un bref résumé de la publication citée est en cours de préparation.

Auteurs:
PG
Dr. Patay Gábor
médecin, spécialiste du microbiote
BA
Dr. Bezzegh Attila
directeur médical, microbiologiste clinique
AM
Dra. Anna Munar
médecin, spécialiste de l'exposome
MicroBiome Bank — contenu professionnel validé médicalement. Dernière mise à jour : 2026.