II. 6. La sélection des donneurs et la sécurité du produit

Il est rassurant de savoir ce qui se trouve derrière votre gélule : une sélection stricte des donneurs selon les standards internationaux, une analyse sanguine réalisée deux fois, un vaste panel de pathogènes et une fabrication contrôlée. Vous découvrez ici toute la chaîne de sécurité.

Le parcours du donneur – la sélection stricte

Le contenu d'une gélule DiffBiome provient d'un donneur^[G] humain sain – mais pour qu'une personne devienne donneur, elle doit passer par un très grand nombre de filtres. L'objectif est double : d'une part garantir que la flore du donneur est saine, diversifiée et de valeur, et d'autre part exclure tout risque de transmettre au receveur^[G] des infections ou d'autres pathogènes.

La sélection des donneurs^[G] n'est pas un test unique, mais un processus soigneusement construit qui suit les standards professionnels internationaux. Elle commence par un questionnaire détaillé sur la santé et le mode de vie, qui exclut déjà beaucoup : si une personne souffre par exemple d'une maladie inflammatoire chronique de l'intestin, il s'agit d'un critère d'exclusion absolu. Nous prêtons également attention à l'alimentation du donneur : les protéines animales qu'il consomme doivent être exemptes d'antibiotiques et de vermifuges, car ces substances parviendraient, via la viande, jusqu'à la flore intestinale du donneur et pourraient dégrader la qualité du greffon. C'est pourquoi nous ne nous en remettons pas à l'approvisionnement commercial : la MicroBiome Bank exploite sa propre ferme sous le nom de Cservölgy Major, où elle élève des chèvres, des moutons et des bovins – ainsi cette partie de l'alimentation des donneurs reste en permanence sous notre contrôle.

L'une des pierres angulaires de la sélection est que nous réalisons l'analyse sanguine non pas une fois, mais deux fois, à huit semaines d'intervalle. Cela compte, car certaines infections comportent une « fenêtre sérologique » pendant laquelle elles ne sont pas encore détectables – un test réalisé deux fois, à distance dans le temps, ferme cette brèche. Seul un donneur qui passe les deux tours peut poursuivre.

La sécurité du produit – de la fabrication à la gélule

À partir de là, la flore du donneur sélectionné entre dans un processus de fabrication contrôlé. Nous débarrassons la matière première des pathogènes, la transformons en une suspension bactérienne vivante, puis la séchons en douceur et la conditionnons en gélules. Le procédé n'est pas une production industrielle de masse, mais suit des normes de qualité strictes – ce que l'on appelle les GMP, les bonnes pratiques de fabrication : nous contrôlons chaque lot, entre autres pour nous assurer qu'il contient suffisamment de bactéries viables et rien qui ne devrait s'y trouver.

Chaque dose reçoit un identifiant traçable, appelé numéro de LOT. C'est comme un acte de naissance : il indique exactement de quel donneur, à quel moment et à partir de quel lot votre gélule a été fabriquée. C'est pourquoi il est important d'inscrire toujours le numéro de LOT dans votre journal – si une question devait se poser, toute dose peut ainsi être retracée. Le système de LOT permet aussi de passer à un autre lot si nécessaire.

La gélule contient non seulement des bactéries vivantes, mais aussi quelques excipients qui nourrissent et stabilisent la flore. Ce sont toutes des substances connues et sûres. Le flacon non ouvert se conserve de préférence dans un endroit sombre et frais, en position verticale – la conservation a elle aussi ses règles, pour que les bactéries restent viables. Toute cette chaîne – de la sélection à la conservation en passant par la fabrication – fournit ensemble la sécurité sur laquelle repose votre cure.

🍽️ L'alimentation pendant ces jours

Pendant ces trois jours, vous découvrez la chaîne de sécurité du produit – sélection des donneurs, fabrication et conservation – tandis que votre alimentation continue de suivre la ligne douce et constipante. Vos tâches : prendre la dose quotidienne selon la routine habituelle, boire un verre d'eau supplémentaire après chaque selle plus molle, et ne pas oublier d'inscrire le numéro de LOT dans votre journal, ni de conserver le flacon non ouvert dans un endroit frais et sombre, en position verticale.

Pour ces jours, le Calendrier des plantes recommande des sources apportant des fibres solubles douces et de l'amidon résistant : au jour 19 l'avoine (le bêta-glucane qu'elle contient est une fibre soluble, douce pour l'intestin), au jour 20 la carotte cuite (fibre soluble, à l'effet apaisant), et au jour 21 la pomme de terre cuite puis refroidie, dans laquelle de l'amidon résistant se forme pendant le refroidissement. Ces fibres nourrissent les bonnes bactéries du côlon et favorisent des selles plus fermes pendant que vos symptômes s'apaisent. Intégrez la plante du jour à au moins un repas, cuite ou à la vapeur ; si vous ne tolérez pas bien l'une d'elles, laissez-la de côté et revenez-y plus tard.

Pourquoi est-ce important ?

Si vous savez par quelle sélection stricte et quelle fabrication contrôlée passe votre gélule, il est plus facile de poursuivre la cure avec confiance et sérénité. Consigner le numéro de LOT est votre part dans cette chaîne de sécurité : grâce à cela, chaque dose reste traçable – ce qui sert votre sécurité.

Références

[015] Marcella C, Cui B, Kelly CR, Ianiro G, Cammarota G, Zhang F. Systematic review: the global incidence of faecal microbiota transplantation-related adverse events from 2000 to 2020. Aliment Pharmacol Ther. 2021. Link

Revue systématique de la sécurité de la FMT résumant les événements indésirables (EI) sur 20 ans à partir de 129 études incluant 4 241 patients et 5 688 cures de FMT (recherche dans EMBASE, MEDLINE, Cochrane, CNKI, Wanfang de 2000 à 2020). Les EI ont été classés en EI liés à l'administration ou liés au microbiote. Cette revue fournit le plus vaste ensemble agrégé de données de sécurité de la FMT à ce jour et conforte le profil de sécurité globalement favorable de la FMT dans les CDI récidivantes, tout en signalant que les complications pourraient être sous-rapportées dans la littérature.

[016] Cammarota G, Ianiro G, Tilg H et al. European consensus conference on faecal microbiota transplantation in clinical practice. Gut. 2017. Link

Conférence de consensus européenne élaborant des recommandations fondées sur les preuves relatives à la FMT en pratique clinique, avec 28 experts de 10 pays collaborant au sein de groupes de travail. Les énoncés ont été produits par une revue fondée sur les preuves, évalués électroniquement par un processus Delphi, puis finalisés lors d'une séance plénière de consensus. Les recommandations portent sur les indications de la FMT, la sélection des donneurs, la préparation du matériel fécal, la prise en charge clinique, l'administration des selles et les exigences minimales pour créer un centre de FMT. Le document fournit le cadre européen de standardisation d'une FMT sûre et encadrée.

[033] Dethlefsen L, Relman DA. Incomplete recovery and individualized responses of the human distal gut microbiota to repeated antibiotic perturbation. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2011. Link

Étude longitudinale menée à Stanford qui a suivi le microbiome intestinal de trois personnes pendant 10 mois, au fil de deux cures consécutives de ciprofloxacine, par séquençage profond de l'ARNr 16S. La perte de diversité bactérienne a été profonde et rapide, dans les 3–4 jours suivant le début de l'antibiotique ; le retour à l'état antérieur au traitement est souvent resté incomplet même des mois après l'arrêt de la cure. L'exposition répétée aux antibiotiques a engendré des déplacements croissants et non restaurables dans la composition de la communauté. Avec plus de 2000 citations, il s'agit de la référence classique qui établit que la dysbiose causée par les antibiotiques n'est pas un trouble qui se corrige de lui-même, mais qu'elle peut laisser une empreinte écologique durable – un point clé dans l'argumentation en faveur de la MTT chez les patients ayant des antécédents d'exposition cumulée aux antibiotiques.

[046] Chen RA, Wu WK, Panyod S, Liu PY, Chuang HL, Chen YH, Lyu Q, Hsu HC, Lin TL, Shen TD, Yang YT, Zou HB, Huang HS, Lin YE, Chen CC, Ho CT, Lai HC, Wu MS, Hsu CC, Sheen LY. Dietary Exposure to Antibiotic Residues Facilitates Metabolic Disorder by Altering the Gut Microbiota and Bile Acid Composition. mSystems. 2022. Link

Étude empirique qui quantifie la manière dont l'exposition alimentaire chronique à des résidus subthérapeutiques d'antibiotiques (concrètement la tylosine à des doses Theoretical Maximum Daily Intake, TMDI) modifie la composition du microbiote intestinal et le métabolisme des acides biliaires, provoquant un dysfonctionnement métabolique mesurable dans des modèles animaux. Le phénotype lié à l'obésité était transférable à des souris receveuses axéniques, ce qui indique que l'effet est médié par le microbiote altéré lui-même. L'exposition en début de vie a entraîné des conséquences métaboliques durables via la signalisation de FGF15. C'est la preuve empirique la plus récente à l'appui de l'exclusion catégorique, exposée à la section VIII. 2., de la protéine animale conventionnelle traitée aux antibiotiques, tant du régime du donneur que de celui du receveur après la MTT.

[097] Palleja A, Mikkelsen KH, Forslund SK et al. Recovery of gut microbiota of healthy adults following antibiotic exposure. Nature Microbiology. 2018. Link

Étude par métagénomique shotgun chez 12 hommes en bonne santé : après une cure de 4 jours associant trois antibiotiques de dernier recours (méropénème, gentamicine, vancomycine), le microbiote intestinal s'est rétabli en grande partie mais de façon incomplète en six mois — plusieurs espèces communes sont restées absentes et des gènes de résistance ont été transitoirement enrichis.

[098] Karmisholt Grosen A et al. Effects of clinical donor characteristics on the success of faecal microbiota transplantation for patients in Denmark with Clostridioides difficile infection: a single-centre, prospective cohort study. The Lancet Microbe. 2025. Link

Cohorte danoise prospective monocentrique : les caractéristiques cliniques du donneur — dont l'exposition aux antibiotiques dans les 12 mois précédant le don et la consistance des selles données — influent sur le succès de la FMT dans l'infection récidivante à C. difficile ; l'usage d'antibiotiques par le donneur détériore les résultats, ce qui appuie un dépistage strict des donneurs.

[100] Kelly CR, Ihunnah C, Fischer M, Khoruts A, Surawicz C, Afzali A, Aroniadis O, Barto A, Borody T, Giovanelli A, Gordon S, Gluck M, Hohmann EL, Kao D, Kao JY, McQuillen DP, Mellow M, Rank KM, Rao K, Ray A, Schwartz MA, Singh N, Stollman N, Suskind DL, Vindigni SM, Youngster I, Brandt L. **. American Journal of Gastroenterology. 2014. Link

L'infection à Clostridium difficile (ICD) est particulièrement dangereuse chez les patients immunodéprimés, mais la sécurité de la transplantation de microbiote fécal (TMF) dans ce groupe restait incertaine. Cette série rétrospective de 16 centres a étudié 80 patients immunodéprimés (75 adultes, 5 enfants) dont l'ICD était récidivante (55%), réfractaire (11%) ou sévère/mixte (34%); les causes d'immunodépression incluaient le VIH/sida, la transplantation d'organe, une maladie oncologique, l'immunosuppression pour maladie inflammatoire de l'intestin et d'autres affections. Le taux de guérison de l'ICD après une seule TMF était de 78%, et la procédure s'est révélée globalement sûre : les événements indésirables graves dans les 12 semaines étaient rares et ne suggéraient pas d'infection transmise par la TMF. Les auteurs concluent que la TMF est une option efficace et sûre contre l'ICD, même chez les patients immunodéprimés.

[735] Cammarota G, Ianiro G, Kelly CR et al. International consensus conference on stool banking for faecal microbiota transplantation in clinical practice. Gut. 2019. Link

Ce consensus international, réunissant des experts de la FMT d'Europe, d'Amérique du Nord et d'Australie, formule des recommandations sur les banques de selles pour la FMT, couvrant les principes généraux, l'organisation, la sélection et le dépistage des donneurs, le recueil, la préparation et la conservation des selles, les services et les clients, les registres, le suivi des résultats, l'éthique et le rôle clinique évolutif de la FMT. Le consensus a été obtenu par des tours Delphi complétés par une discussion plénière, les énoncés étant étayés par les meilleures données disponibles. Le document guide le développement mondial des banques de selles afin de promouvoir un accès sûr et équitable à la FMT dans l'infection récidivante à C. difficile.