V. 3. Jeûne intermittent

En alternant fenêtres d'alimentation et de jeûne, le jeûne intermittent est bien plus qu'un outil de perte de poids ; il remodèle en douceur le fonctionnement de vos microbes intestinaux et le maintien de leur diversité.

Pas seulement un outil de perte de poids, mais un régulateur microbien

Le jeûne intermittent (JI) est un schéma alimentaire qui alterne périodes de prise alimentaire et périodes de jeûne, influençant profondément la composition et la fonction du microbiote intestinal.

Le lien entre les pratiques de jeûne religieux et la recherche sur le microbiote humain n'a été exploré jusqu'ici que dans de petites études pilotes et quelques cohortes contrôlées. Özkul, Yalınay et Karakan ont examiné le microbiote fécal de neuf volontaires musulmans adultes en bonne santé avant et à la fin du jeûne du ramadan de 29 jours (environ 17 heures de jeûne par jour) (Turkish Journal of Gastroenterology, 2019). [585] Le ramadan offre un modèle naturel d'alimentation à horaires restreints : un jeûne quotidien complet du lever au coucher du soleil pendant environ 30 jours, suivi de prises alimentaires pendant les heures nocturnes. Malgré cet horaire nocturne des prises alimentaires – dont on pourrait attendre qu'il perturbe l'alignement circadien –, la stricte régularité de la fenêtre de jeûne a produit des modifications du microbiote mesurables et constantes. Cette étude pilote humaine (Turkish Journal of Gastroenterology, 2019 ; neuf volontaires adultes en bonne santé) a constaté que le jeûne du ramadan était associé à une augmentation de plusieurs taxons bénéfiques, dont Akkermansia muciniphila – une bactérie associée au mucus, liée à une meilleure intégrité de la barrière et à une meilleure santé métabolique – ainsi que le groupe Bacteroides fragilis, tandis que la glycémie à jeun et le cholestérol total diminuaient. [585] Dans une étude de suivi de la même équipe, la richesse microbienne (OTU observées) augmentait elle aussi significativement après le ramadan, alors que l'indice de Shannon et la diversité phylogénétique ne variaient pas sensiblement (Beneficial Microbes, 2020) ; compte tenu du faible effectif et de l'absence de groupe témoin, ces résultats sont générateurs d'hypothèses. Une étude humaine plus vaste et contrôlée a été rapportée par Su et ses collègues dans l'American Journal of Clinical Nutrition en 2021 : elle a échantillonné le microbiote de volontaires en bonne santé (27 jeûneurs, 10 témoins non jeûneurs) au début et à la fin du jeûne du ramadan, puis un mois plus tard. Les indices de diversité microbienne augmentaient pendant la période de jeûne par rapport à l'état initial, principalement du fait de l'enrichissement des familles Lachnospiraceae et Ruminococcaceae ; après la fin du jeûne, en revanche, la composition du microbiome est revenue à son état initial – l'effet est donc réversible et ne se maintient pas. [586] Ces résultats complètent une littérature plus large sur le jeûne intermittent, montrant qu'une privation cyclique de substrat – quel que soit le calendrier exact – peut modifier la composition microbienne au profit de taxons mieux adaptés à des conditions de substrat fluctuantes. Les organismes tolérants aux états périodiques de faible disponibilité en nutriments peuvent prendre un avantage relatif pendant les intervalles de jeûne, tandis qu'une alimentation continue favorise les organismes optimisés pour une disponibilité constante du substrat. [459] La portée clinique du jeûne intermittent pour le microbiote ne tient donc pas à un protocole particulier. Elle tient au rétablissement d'une variation cyclique du substrat, qui est l'état ancestral par défaut de l'intestin humain. Les schémas alimentaires modernes très réguliers, à disponibilité continue de substrat, représentent une condition évolutivement inédite. La littérature sur le JI – y compris les données sur le ramadan – fournit des preuves convergentes que le microbiote intestinal répond favorablement à une restriction périodique de substrat, et que ces réponses peuvent persister au-delà de la fenêtre de jeûne elle-même.

Le jeûne intermittent (JI) est couramment décrit comme une alternance de périodes avec et sans prise alimentaire. D'un point de vue physiologique, ces intervalles sans prise alimentaire ne sont pas de simples vides entre les repas. Ce sont des phases où la digestion ralentit, où la signalisation hormonale change et où l'activité intestinale se modifie, transformant l'environnement dans lequel les microbes intestinaux fonctionnent [459].

Pendant les périodes d'alimentation, la motilité intestinale, la sécrétion biliaire et le flux de nutriments soutiennent une digestion active et la fermentation des substrats alimentaires. Quand la prise alimentaire cesse, ces processus évoluent progressivement. La motilité devient moins dépendante des repas, les schémas d'exposition à la bile changent et les microbes s'appuient davantage sur des composés issus de l'hôte et sur des produits de fermentation résiduels. Plutôt que de réduire la charge microbienne, le jeûne modifie surtout les types de substrats et de signaux disponibles dans l'intestin, ce qui peut influencer le comportement microbien et la compétition [111].

Certains groupes microbiens semblent mieux adaptés à ces conditions. Dans plusieurs études humaines et animales, l'alimentation à horaires restreints a été associée à des glissements vers des taxons liés à l'utilisation du mucus et aux voies de fermentation des fibres, y compris, dans certaines cohortes, à des augmentations d'organismes comme Akkermansia muciniphila. Ces résultats ne sont pas constants d'une étude à l'autre et dépendent fortement de la composition de l'alimentation, du microbiote initial et de la santé métabolique.

La production d'acides gras à chaîne courte, en particulier de butyrate, est souvent évoquée à propos du jeûne. Ces métabolites sont pourtant produits principalement à partir des fibres fermentescibles consommées pendant les périodes d'alimentation. Le jeûne en lui-même ne génère pas de SCFA, mais il peut influencer le calendrier et le rythme de l'activité de fermentation, ce qui peut modifier la façon dont les cellules épithéliales sont exposées aux métabolites microbiens au fil de la journée.

Le jeûne intermittent interagit aussi avec la régulation circadienne. Concentrer les prises alimentaires dans des fenêtres diurnes prévisibles peut renforcer les rythmes quotidiens de sensibilité à l'insuline, de sécrétion hormonale et de signalisation immunitaire. Comme l'activité microbienne suit dans une large mesure les rythmes de l'hôte, des cycles alimentation–jeûne plus nets peuvent aider à stabiliser les oscillations microbiennes fonctionnelles, en particulier chez les personnes à horaires irréguliers ou au sommeil perturbé.

Au niveau du métabolisme de l'hôte, le jeûne active des voies de réponse au stress cellulaire et réduit la signalisation inflammatoire postprandiale. Ces effets concernent d'abord les tissus de l'hôte, mais ils façonnent aussi le milieu intestinal par des modifications du renouvellement épithélial, de l'activité immunitaire et de la signalisation nutritionnelle. De tels changements peuvent influencer indirectement la dynamique des communautés microbiennes, en particulier dans les situations d'inflammation chronique de bas grade.

Fait important, toutes les stratégies de jeûne n'exercent pas la même pression physiologique. L'alimentation quotidienne à horaires restreints, la restriction calorique périodique et le jeûne un jour sur deux diffèrent nettement par leur charge métabolique, leur tolérance digestive et leur soutenabilité comportementale. Les personnes atteintes de maladie métabolique, soumises à de fortes contraintes physiques ou à digestion sensible peuvent réagir différemment à des protocoles identiques, ce qui souligne l'importance de la personnalisation.

C'est pourquoi le jeûne intermittent fonctionne au mieux comme un rythme régulateur plutôt que comme une intervention agressive. Une adaptation progressive permet aux processus digestifs, à la régulation métabolique et aux communautés microbiennes de s'ajuster ensemble. Appliqué de cette manière, le JI peut soutenir des schémas métaboliques et microbiens plus stables dans la durée, non pas en « réinitialisant » directement le microbiote, mais en rétablissant des conditions physiologiques plus prévisibles dans lesquelles hôte et microbes peuvent coexister en équilibre fonctionnel.

Comment intégrer le jeûne intermittent au service de la santé microbienne

Commencez par une période nocturne de 12 heures sans prise alimentaire (p. ex. 20 h–8 h) et allongez-la progressivement vers 14–16 heures seulement si elle est bien tolérée. Ces fenêtres sont des recommandations cliniques pratiques fondées sur la tolérance, et non des seuils validés par un essai chez l'humain. Des données humaines existent pour le jeûne du ramadan de 30 jours, de l'aube au coucher du soleil, qui s'est accompagné chez des adultes en bonne santé d'une augmentation d'Akkermansia muciniphila et des Lachnospiraceae, et dont les effets se sont largement estompés après la période de jeûne. L'effet dose-dépendant de la durée quotidienne du jeûne sur le microbiote a en revanche été démontré chez des souris mâles C57BL/6J (12, 16 ou 20 heures de jeûne quotidien pendant un mois), et ce résultat animal n'est pas directement transposable à l'humain [587].

Choisissez un schéma de jeûne compatible avec votre routine quotidienne et votre état de santé (p. ex. une alimentation quotidienne à horaires restreints de type 14:10 ou 16:8 ; évitez les protocoles rigides si l'observance est difficile). [086]

Maintenez une hydratation suffisante pendant le jeûne avec de l'eau ou des tisanes non sucrées ; le café noir convient à certains, mais évitez les édulcorants et les boissons caloriques.

Pendant les périodes d'alimentation, évitez la suralimentation compensatoire ; privilégiez des repas réguliers et équilibrés plutôt que de gros rattrapages.

Préférez des fenêtres alimentaires diurnes, en alignant les prises alimentaires sur l'activité métabolique circadienne normale lorsque c'est possible.

Utilisez le niveau d'énergie, le confort digestif, la qualité du sommeil et la concentration comme indicateurs pratiques de tolérance et d'adaptation.

Si vous avez une sensibilité gastro-intestinale ou si vous vous remettez d'une dysbiose^[G], des fenêtres de jeûne plus courtes et une progression plus lente sont conseillées.

Évitez les entraînements de haute intensité pendant les jeûnes prolongés, surtout dans la phase initiale d'adaptation ; une activité légère est généralement mieux tolérée.

Veillez à ce que les repas contiennent suffisamment de fibres alimentaires et de protéines, car la production de métabolites microbiens dépend avant tout de la qualité du substrat, et non du jeûne lui-même.

Rompez le jeûne par des repas de taille modérée et faciles à digérer, en évitant les portions très abondantes ou les aliments très transformés susceptibles de provoquer des symptômes digestifs.

Effets sur le microbiote

• Le jeûne intermittent est associé à des modifications de la composition et des schémas fonctionnels du microbiote, mais les effets sur la diversité varient d'une personne à l'autre et dépendent fortement de l'alimentation et de l'état métabolique initial.
• Les périodes de jeûne modifient l'environnement physiologique de l'intestin et sont, dans certaines études, associées à de meilleurs marqueurs de perméabilité intestinale, même si des effets directs de « réparation » muqueuse ne sont pas démontrés chez l'humain [587].
• Le jeûne active des voies métaboliques et de réponse au stress cellulaire associées à une signalisation inflammatoire réduite, mais des baisses directes de l'endotoxémie ne sont pas démontrées de façon constante dans les études humaines.
• La production d'acides gras à chaîne courte est déterminée principalement par l'apport en fibres alimentaires ; le jeûne intermittent peut influencer le calendrier et le rythme de la fermentation plutôt que la production totale de SCFA.
• Le JI peut influencer les interactions intestin–immunité par la régulation métabolique et hormonale de l'hôte, mais les variations observées des cytokines ne peuvent pas être attribuées uniquement à des mécanismes médiés par le microbiote.
• Consolider les fenêtres alimentaires peut améliorer l'alignement circadien de l'hôte, ce qui peut secondairement influencer les rythmes quotidiens d'activité microbienne.
• Des intervalles plus longs sans prise alimentaire peuvent réduire la charge de fermentation liée aux repas, ce qui chez certaines personnes peut atténuer les ballonnements et les gaz, en particulier en cas de digestion sensible.
• Les données humaines directes montrant que le JI renforce la résistance à la colonisation^[G] sont limitées, même si un environnement intestinal plus stable pourrait théoriquement réduire la susceptibilité à la prolifération de pathogènes.
• Le jeûne intermittent peut améliorer la flexibilité métabolique et la sensibilité à l'insuline principalement par la régulation métabolique de l'hôte, les modifications du microbiote agissant comme modulateurs plutôt que comme moteurs principaux.
• Les effets sur l'humeur, les performances cognitives et la résilience au stress reflètent probablement des changements combinés dans plusieurs systèmes physiologiques (sommeil, rythmes hormonaux, régulation du glucose), et non les seuls glissements du microbiote.

Conseils au patient

• Commencez par au moins 12 heures sans prise alimentaire pendant la nuit, et allongez progressivement à 14–16 heures seulement si c'est bien toléré.
• Choisissez un schéma de jeûne tenable avec votre routine quotidienne et votre état de santé.
• Pendant les périodes de jeûne, buvez de l'eau ou des tisanes non sucrées ; évitez les boissons caloriques et les édulcorants.
• Pendant les périodes d'alimentation, prenez des repas réguliers et équilibrés et évitez la suralimentation compensatoire.
• Lorsque c'est possible, mangez plus tôt dans la journée et évitez les repas copieux en fin de soirée.
• Pour rompre le jeûne, choisissez des portions modérées d'aliments faciles à digérer.
• Pendant la phase d'adaptation, évitez l'exercice de haute intensité au cours des jeûnes plus longs.
• Surveillez le niveau d'énergie, les symptômes digestifs et la qualité du sommeil, et ajustez la durée du jeûne en conséquence.
• Si vous présentez des symptômes gastro-intestinaux, une dénutrition ou une maladie chronique, ne pratiquez le jeûne qu'après avis médical.
• Privilégiez la régularité et la constance plutôt que la restriction extrême.

Références

[086] Chaix A, Manoogian ENC, Melkani GC, Panda S. Time-Restricted Eating to Prevent and Manage Chronic Metabolic Diseases. Annu Rev Nutr. 2019. Link

Des horloges moléculaires sont présentes dans presque chaque cellule afin d'anticiper les changements quotidiens récurrents et prévisibles, comme la disponibilité rythmique des nutriments, et d'adapter en conséquence les fonctions cellulaires. Parallèlement, les voies de détection des nutriments peuvent répondre à un déséquilibre nutritionnel aigu et moduler et orienter le métabolisme afin que les cellules s'adaptent de façon optimale à une disponibilité décroissante ou croissante des nutriments. Les rythmes circadiens de l'organisme sont coordonnés par des rythmes comportementaux tels que les cycles activité-repos et alimentation-jeûne, afin d'orchestrer temporellement une séquence de processus physiologiques optimisant le métabolisme. La recherche fondamentale sur les rythmes circadiens s'est largement concentrée sur le fonctionnement de l'oscillateur circadien moléculaire auto-entretenu, tandis que la recherche en nutrition a éclairé les réponses physiologiques à la privation calorique ou à des macronutriments spécifiques. L'intégration de ces deux champs en nouveaux concepts actionnables sur le moment de la prise alimentaire a conduit à la pratique émergente de l'alimentation à horaires restreints. Dans ce paradigme, l'apport calorique quotidien est restreint à une fenêtre constante de 8 à 12 h.

[111] Koh A, De Vadder F, Kovatcheva-Datchary P, Bäckhed F. From Dietary Fiber to Host Physiology: Short-Chain Fatty Acids as Key Bacterial Metabolites. Cell. 2016. Link

Revue mécanistique sur les acides gras à chaîne courte (AGCC), produits par la fermentation bactérienne des fibres alimentaires. Les fibres fermentescibles sont la source d'énergie primaire du microbiote colique ; les principaux produits de fermentation sont l'**acétate, le propionate et le butyrate**. Le **butyrate est le principal substrat énergétique des colonocytes** ; les AGCC influencent aussi l'intégrité de la barrière, la fonction immunitaire et, une fois dans la circulation, le métabolisme de l'hôte, en partie via des récepteurs couplés aux protéines G (GPR41/43) et l'inhibition des histone-désacétylases. Cette entrée est la source des affirmations de manuel du III.2 (S-0302-01, -02). Important : il s'agit d'une **revue**, non de données expérimentales propres.

[459] Sonnenburg JL, Bäckhed F. Diet–microbiota interactions as moderators of human metabolism. Nature. 2016. Link

Revue des mécanismes reliant le microbiote intestinal à l'obésité et au diabète de type 2, s'appuyant sur des modèles animaux translationnels et des études humaines. Le microbiote apparaît comme un médiateur de l'impact de l'alimentation sur le statut métabolique de l'hôte, avec des efforts croissants pour établir des relations causales chez l'homme et développer des interventions thérapeutiques, y compris la nutrition personnalisée.

[585] Özkul C, Yalınay M, Karakan T. Islamic fasting leads to an increased abundance of Akkermansia muciniphila and Bacteroides fragilis group: A preliminary study on intermittent fasting. Turkish Journal of Gastroenterology. 2019. Link

Neuf volontaires musulmans adultes en bonne santé ont été prélevés avant et à la fin du jeûne du Ramadan de 29 jours (environ 17 heures de jeûne quotidien), au moyen d'une PCR quantitative ciblée sur les selles. Après le jeûne, tous les participants présentaient une augmentation significative de l'abondance relative d'Akkermansia muciniphila et du groupe Bacteroides fragilis par rapport à l'inclusion, ainsi qu'une baisse significative de la glycémie à jeun et du cholestérol total. Les auteurs concluent que le jeûne islamique, en tant que forme de jeûne intermittent, enrichit des taxons intestinaux généralement considérés comme bénéfiques. Compte tenu de l'effectif très faible (n = 9), de l'absence de groupe témoin et du contrôle incomplet de la composition alimentaire, ce résultat est générateur d'hypothèses et non confirmatoire.

[586] Su, J.; Wang, Y.; Zhang, X.; Ma, M.; Xie, Z.; Pan, Q.; Ma, Z.; Peppelenbosch, M. P. Remodeling of the gut microbiome during Ramadan-associated intermittent fasting. The American Journal of Clinical Nutrition 113(5):1332–1342. 2021. Link

Étude humaine menée sur deux cohortes (27 volontaires jeûnant et 10 ne jeûnant pas), avec prélèvements de selles et de sang au début du Ramadan, à la fin du Ramadan et un mois plus tard. Le jeûne intermittent associé au Ramadan a augmenté la diversité du microbiome intestinal et était spécifiquement associé à une augmentation des familles issues des Clostridiales, Lachnospiraceae (non jeûneurs 24,6 ± 13,7 % vs jeûneurs 39,7 ± 15,9 % d'abondance relative) et Ruminococcaceae. La composition du microbiome est revenue à son état initial après l'arrêt de l'alimentation intermittente, ce qui indique que l'effet est réversible et lié au maintien de la fenêtre de jeûne.

[587] Li L, Su Y, Li F et al. The effects of daily fasting hours on shaping gut microbiota in mice. BMC Microbiol. 2020. Link

Des souris mâles C57BL/6J ont été soumises à un jeûne quotidien de 12, 16 ou 20 heures pendant 1 mois, suivi de 1 mois en ad libitum. La prise alimentaire cumulée était inchangée avec 12 heures de jeûne mais significativement diminuée avec 16 et 20 heures de jeûne. La composition du microbiote intestinal a été modifiée par tous les protocoles de jeûne intermittent, l'ampleur du jeûne déterminant la réduction de l'apport calorique et la modulation du microbiote. Ces résultats montrent que la durée du jeûne quotidien façonne de manière notable à la fois l'apport énergétique et la composition du microbiote intestinal.