XV.2.

Perfil 2: enfermedad inflamatoria intestinal, indiferenciada / combinada (IBD)

Cuando la enfermedad inflamatoria intestinal no encaja con claridad en la colitis ulcerosa ni en la enfermedad de Crohn, este perfil orienta un abordaje prudente y combinado del FMT.

ParámetroDetalle específico de la IBD
Nivel de evidencia★★★☆☆ Moderada. La colitis ulcerosa (perfil 2) y la enfermedad de Crohn (perfil 3) se perfilan por separado con evidencia específica de cada cuadro. Este perfil combinado de IBD se aplica a los pacientes con IBD no clasificada (IBD-U), fenotipos de solapamiento o presentaciones clínicas que no encajan con claridad en los criterios de CU o de EC. La base de evidencia procede de los ensayos en CU y EC; los datos de ensayos de FMT específicos en IBD-U son limitados.
Mecanismo de la disbiosisDisbiosis nuclear de la IBD: menor diversidad microbiana; inversión del cociente Firmicutes/Bacteroidetes; depleción de Faecalibacterium prausnitzii; expansión de Proteobacteria (en especial E. coli adherente-invasiva en el tipo EC); resistencia a la colonización deteriorada; disfunción de la barrera mucosa; respuestas inmunitarias innatas y adaptativas desreguladas frente a la microbiota luminal.
Dianas microbianas principalesRestaurar F. prausnitzii y las Lachnospiraceae productoras de butirato. Suprimir E. coli adherente-invasiva. Reconstruir la resistencia a la colonización. Normalizar el tono inmunitario de la mucosa (equilibrio Treg/Th17). Restablecer la producción de ácidos grasos de cadena corta para el aporte energético de los colonocitos.
Modificación del protocoloProtocolo completo de 4 fases. Se recomienda revisar la clasificación antes de iniciar el FMT: si los datos clínicos o histológicos posteriores permiten reclasificar el cuadro como CU o EC, aplíquese el perfil específico de la enfermedad correspondiente. Enfermedad activa grave: los pacientes con IBD-U y actividad grave (CDAI >300 o Mayo ≥9) deben estabilizarse antes del FMT. Biológicos e inmunosupresores: mantener a dosis estables; no modificarlos durante el FMT salvo indicación del gastroenterólogo.
Duración mínima de la transferencia60 días como mínimo; se prefieren 90 días en la IBD-U dada la incertidumbre diagnóstica. La duración debe reevaluarse a los 60 días en el contexto de la trayectoria de los síntomas y de cualquier reclasificación.
Foco prioritario del exposomaFibra alimentaria (soluble y fermentable; precaución con la fibra insoluble durante los brotes). Reducir los alimentos ultraprocesados, los emulsionantes y los edulcorantes artificiales (todos ellos documentados como agravantes de la disbiosis de la IBD). Patrón dietético antiinflamatorio. Reducción del estrés: el eje HPA empeora directamente la integridad de la barrera mucosa. Calidad del sueño: un sueño deficiente amplifica los ciclos inflamatorios de la IBD.
Cronología esperable de la respuestaFrecuencia y consistencia de las heces: mejoría en 2–4 semanas en las presentaciones de tipo CU; más lenta en las de tipo EC (4–8 semanas). Biomarcadores inflamatorios (PCR, calprotectina fecal): 4–8 semanas. Curación mucosa endoscópica: 12–24 semanas. Calidad de vida: 4–12 semanas.
Signos de alarma (específicos de la IBD)Fiebre ≥38 °C (brote de IBD o complicación infecciosa: contacto clínico inmediato). Sangrado rectal significativo o cambio en las características de las heces. Dolor abdominal intenso. Cualquier síntoma que cumpla los criterios de emergencia de nivel 1 (véase el capítulo II). Empeoramiento de las manifestaciones extraintestinales (articulaciones, ojos, piel): puede reflejar actividad inflamatoria sistémica. Nuevos síntomas perianales (riesgo de complicación de tipo EC).

Tabla 13 – Perfil clínico: enfermedad inflamatoria intestinal indiferenciada (IBD-U) # Parámetros del protocolo, nivel de evidencia y modificaciones clínicas específicas de la IBD-U.

Nota: en los pacientes con IBD-U debe revisarse la reclasificación diagnóstica a los 6–12 meses; la clasificación actualizada debe utilizarse para guiar la selección continuada del protocolo. Este perfil no sustituye al manejo específico de la CU o de la EC cuando la clasificación es clara.

FMT en la IBD: marco clínico de 2024

El consenso ECCO de 2024 (Caenepeel et al., J Crohn Colitis) categoriza el FMT como recomendado de forma condicional en la CU, no recomendado en la enfermedad de Crohn y como evidencia emergente para el subgrupo de CU refractaria a biológicos [430]. El protocolo de FMT específico de la IBD difiere sustancialmente del protocolo de la rCDI: inducción con dosis múltiples (colonoscopia + 6–8 semanas de consolidación en cápsulas), se prefiere el agrupamiento de varios donantes para maximizar la diversidad de cepas, y la evaluación de compatibilidad entre donante y receptor es obligatoria.

Puntos clave de decisión clínica en el FMT para la IBD

ParámetroEspecificación
Ventana de indicación óptimaCU leve-moderada, sin exposición previa a biológicos o tras el fracaso del primer biológico
Vía de administraciónInducción por colonoscopia + consolidación en cápsulas (≥6 semanas)
Elección del donanteGrupo de varios donantes (3–5 donantes) en la CU; superdonante en los casos con solapamiento con IBS
Respuesta esperableCU: 36 % de remisión clínica en la semana 8; remisión sostenida a 5 años: 26 % [431]
Marcadores de respuesta precozReducción de la calprotectina ≥50 % en la semana 4
Manejo de la no respuestaCombinación con biológico (vedolizumab[G]) – ensayo FACTU [432]
Seguimiento a largo plazoValoración clínica anual, calprotectina, microbioma fecal (a nivel de cepa)

La combinación de vedolizumab y FMT (Sokol et al. 2024, FACTU fase 3) es una nueva opción clínica relevante en la CU refractaria a biológicos: el bloqueo de α4β7-MAdCAM-1[G] por el vedolizumab reduce localmente el tráfico de linfocitos T inflamatorios, mientras que el FMT restablece la resistencia a la colonización[G] y la producción de butirato. 41 % de respuesta clínica en la semana 8 frente al 18 % con vedolizumab en monoterapia [432].

En la enfermedad de Crohn (véase XV.5) la evidencia es más débil, pero en el subgrupo ileocolónico sin exposición previa a biológicos, Sokol 2024 (Lancet Gastroenterol Hepatol) halló que el injerto a nivel de cepa de Faecalibacterium prausnitzii del filogrupo II tenía valor predictivo [433].

Referencias

[430] Caenepeel C, Sokol H, Hold G et al. ECCO Topical Review: Use of Fecal Microbiota Transplantation in IBD. Journal of Crohn's and Colitis. 2024. Link

[431] Paramsothy S, Nielsen S, Kamm MA et al. Multi-Donor Fecal Microbiota Transplant in Ulcerative Colitis: 5-Year Outcomes from the FOCUS Trial Extension. Gastroenterology. 2024. Link

[432] Sokol H, Landman C, Seksik P et al. Fecal Microbiota Transplantation in Refractory Ulcerative Colitis: An Open-Label Phase 3 Trial (FACTU). Gut. 2024. Link

[433] Sokol H, Brot L, Stefanescu C et al. Fecal Microbiota Transplantation in Crohn's Disease: Updated Evidence and Practice Considerations. Lancet Gastroenterology \& Hepatology. 2024. Link

PG
Guía de la Microbiota · Autores: Dr. Patay Gábor — médico, especialista en microbiota · Dr. Bezzegh Attila — director médico, microbiólogo clínico · Dra. Anna Munar — médica, especialista en exposoma
MicroBiome Bank — contenido profesional revisado médicamente. Última actualización: 2026.